Protein–RNA interactions for Protein: O88307

Sorl1, Sortilin-related receptor, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sorl1O88307 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sorl1O88307 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sorl1O88307 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sorl1O88307 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sorl1O88307 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sorl1O88307 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sorl1O88307 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sorl1O88307 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sorl1O88307 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sorl1O88307 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sorl1O88307 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sorl1O88307 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sorl1O88307 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sorl1O88307 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sorl1O88307 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sorl1O88307 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sorl1O88307 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sorl1O88307 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sorl1O88307 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sorl1O88307 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Sorl1O88307 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sorl1O88307 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sorl1O88307 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sorl1O88307 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sorl1O88307 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sorl1O88307 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sorl1O88307 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sorl1O88307 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sorl1O88307 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sorl1O88307 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sorl1O88307 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sorl1O88307 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sorl1O88307 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sorl1O88307 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sorl1O88307 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sorl1O88307 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sorl1O88307 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sorl1O88307 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sorl1O88307 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sorl1O88307 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Sorl1O88307 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sorl1O88307 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sorl1O88307 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Sorl1O88307 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sorl1O88307 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Sorl1O88307 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sorl1O88307 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sorl1O88307 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sorl1O88307 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sorl1O88307 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sorl1O88307 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sorl1O88307 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sorl1O88307 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sorl1O88307 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sorl1O88307 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sorl1O88307 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sorl1O88307 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Sorl1O88307 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Sorl1O88307 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Sorl1O88307 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Sorl1O88307 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Sorl1O88307 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Sorl1O88307 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Sorl1O88307 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sorl1O88307 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sorl1O88307 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sorl1O88307 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sorl1O88307 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sorl1O88307 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sorl1O88307 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Sorl1O88307 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sorl1O88307 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sorl1O88307 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Sorl1O88307 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sorl1O88307 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sorl1O88307 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sorl1O88307 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sorl1O88307 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sorl1O88307 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sorl1O88307 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sorl1O88307 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sorl1O88307 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sorl1O88307 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sorl1O88307 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sorl1O88307 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sorl1O88307 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sorl1O88307 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sorl1O88307 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sorl1O88307 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sorl1O88307 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sorl1O88307 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sorl1O88307 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sorl1O88307 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sorl1O88307 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sorl1O88307 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sorl1O88307 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sorl1O88307 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sorl1O88307 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sorl1O88307 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Sorl1O88307 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms