Protein–RNA interactions for Protein: O70480

Vamp4, Vesicle-associated membrane protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp4O70480 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Vamp4O70480 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Vamp4O70480 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Vamp4O70480 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Vamp4O70480 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Vamp4O70480 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Vamp4O70480 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Vamp4O70480 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Vamp4O70480 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Vamp4O70480 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Vamp4O70480 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Vamp4O70480 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Vamp4O70480 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Vamp4O70480 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Vamp4O70480 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Vamp4O70480 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Vamp4O70480 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Vamp4O70480 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Vamp4O70480 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Vamp4O70480 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Vamp4O70480 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Vamp4O70480 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Vamp4O70480 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Vamp4O70480 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Vamp4O70480 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Vamp4O70480 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Vamp4O70480 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Vamp4O70480 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Vamp4O70480 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Vamp4O70480 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Vamp4O70480 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Vamp4O70480 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Vamp4O70480 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Vamp4O70480 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Vamp4O70480 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Vamp4O70480 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Vamp4O70480 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Vamp4O70480 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Vamp4O70480 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Vamp4O70480 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Vamp4O70480 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Vamp4O70480 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Vamp4O70480 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Vamp4O70480 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Vamp4O70480 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Vamp4O70480 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Vamp4O70480 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Vamp4O70480 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Vamp4O70480 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Vamp4O70480 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Vamp4O70480 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Vamp4O70480 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Vamp4O70480 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Vamp4O70480 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Vamp4O70480 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Vamp4O70480 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Vamp4O70480 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Vamp4O70480 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Vamp4O70480 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Vamp4O70480 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC18.83■□□□□ 0.61
Vamp4O70480 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Vamp4O70480 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Vamp4O70480 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Vamp4O70480 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Vamp4O70480 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Vamp4O70480 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Vamp4O70480 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Vamp4O70480 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Vamp4O70480 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Vamp4O70480 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Vamp4O70480 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Vamp4O70480 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Vamp4O70480 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Vamp4O70480 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Vamp4O70480 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Vamp4O70480 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Vamp4O70480 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Vamp4O70480 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Vamp4O70480 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Vamp4O70480 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Vamp4O70480 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Vamp4O70480 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Vamp4O70480 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Vamp4O70480 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Vamp4O70480 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Vamp4O70480 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Vamp4O70480 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Vamp4O70480 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Vamp4O70480 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Vamp4O70480 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Vamp4O70480 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Vamp4O70480 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Vamp4O70480 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Vamp4O70480 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Vamp4O70480 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Vamp4O70480 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Vamp4O70480 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Vamp4O70480 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Vamp4O70480 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Vamp4O70480 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.9 ms