Protein–RNA interactions for Protein: O70309

Itgb5, Integrin beta-5, mousemouse

Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb5O70309 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Itgb5O70309 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Itgb5O70309 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Itgb5O70309 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Itgb5O70309 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Itgb5O70309 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Itgb5O70309 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Itgb5O70309 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Itgb5O70309 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Itgb5O70309 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Itgb5O70309 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Itgb5O70309 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Itgb5O70309 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Itgb5O70309 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Itgb5O70309 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Itgb5O70309 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Itgb5O70309 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Itgb5O70309 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Itgb5O70309 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Itgb5O70309 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Itgb5O70309 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Itgb5O70309 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Itgb5O70309 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Itgb5O70309 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Itgb5O70309 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Itgb5O70309 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Itgb5O70309 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Itgb5O70309 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Itgb5O70309 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Itgb5O70309 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Itgb5O70309 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Itgb5O70309 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Itgb5O70309 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Itgb5O70309 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Itgb5O70309 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Itgb5O70309 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Itgb5O70309 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Itgb5O70309 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Itgb5O70309 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Itgb5O70309 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Itgb5O70309 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Itgb5O70309 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Itgb5O70309 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Itgb5O70309 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Itgb5O70309 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Itgb5O70309 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Itgb5O70309 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Itgb5O70309 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Itgb5O70309 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Itgb5O70309 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Itgb5O70309 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Itgb5O70309 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Itgb5O70309 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Itgb5O70309 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Itgb5O70309 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Itgb5O70309 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Itgb5O70309 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Itgb5O70309 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Itgb5O70309 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Itgb5O70309 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Itgb5O70309 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Itgb5O70309 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Itgb5O70309 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Itgb5O70309 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Itgb5O70309 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Itgb5O70309 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Itgb5O70309 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Itgb5O70309 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Itgb5O70309 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Itgb5O70309 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Itgb5O70309 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Itgb5O70309 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Itgb5O70309 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Itgb5O70309 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Itgb5O70309 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Itgb5O70309 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Itgb5O70309 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Itgb5O70309 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Itgb5O70309 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Itgb5O70309 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Itgb5O70309 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Itgb5O70309 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Itgb5O70309 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Itgb5O70309 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Itgb5O70309 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Itgb5O70309 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Itgb5O70309 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Itgb5O70309 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Itgb5O70309 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Itgb5O70309 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Itgb5O70309 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Itgb5O70309 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Itgb5O70309 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Itgb5O70309 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Itgb5O70309 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Itgb5O70309 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Itgb5O70309 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Itgb5O70309 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Itgb5O70309 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Itgb5O70309 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.9 ms