Protein–RNA interactions for Protein: O70174

Chrna4, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 629 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrna4O70174 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Chrna4O70174 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Chrna4O70174 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Chrna4O70174 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Chrna4O70174 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Chrna4O70174 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Chrna4O70174 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Chrna4O70174 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Chrna4O70174 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Chrna4O70174 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Chrna4O70174 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Chrna4O70174 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Chrna4O70174 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Chrna4O70174 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Chrna4O70174 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Chrna4O70174 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Chrna4O70174 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Chrna4O70174 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Chrna4O70174 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Chrna4O70174 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Chrna4O70174 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Chrna4O70174 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Chrna4O70174 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Chrna4O70174 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Chrna4O70174 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Chrna4O70174 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Chrna4O70174 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Chrna4O70174 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Chrna4O70174 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Chrna4O70174 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Chrna4O70174 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Chrna4O70174 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Chrna4O70174 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Chrna4O70174 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Chrna4O70174 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Chrna4O70174 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Chrna4O70174 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Chrna4O70174 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Chrna4O70174 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Chrna4O70174 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Chrna4O70174 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Chrna4O70174 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Chrna4O70174 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Chrna4O70174 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Chrna4O70174 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Chrna4O70174 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Chrna4O70174 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Chrna4O70174 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Chrna4O70174 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Chrna4O70174 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Chrna4O70174 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Chrna4O70174 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Chrna4O70174 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Chrna4O70174 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Chrna4O70174 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Chrna4O70174 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Chrna4O70174 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Chrna4O70174 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Chrna4O70174 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Chrna4O70174 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Chrna4O70174 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Chrna4O70174 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Chrna4O70174 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Chrna4O70174 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Chrna4O70174 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Chrna4O70174 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Chrna4O70174 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Chrna4O70174 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Chrna4O70174 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Chrna4O70174 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Chrna4O70174 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Chrna4O70174 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Chrna4O70174 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Chrna4O70174 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Chrna4O70174 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Chrna4O70174 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Chrna4O70174 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Chrna4O70174 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Chrna4O70174 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Chrna4O70174 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Chrna4O70174 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Chrna4O70174 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Chrna4O70174 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Chrna4O70174 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Chrna4O70174 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Chrna4O70174 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Chrna4O70174 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Chrna4O70174 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Chrna4O70174 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Chrna4O70174 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Chrna4O70174 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Chrna4O70174 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Chrna4O70174 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Chrna4O70174 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Chrna4O70174 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Chrna4O70174 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Chrna4O70174 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Chrna4O70174 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Chrna4O70174 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Chrna4O70174 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.5 ms