Protein–RNA interactions for Protein: O55229

Chkb, Choline/ethanolamine kinase, mousemouse

Predictions only

Length 394 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChkbO55229 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ChkbO55229 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ChkbO55229 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ChkbO55229 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ChkbO55229 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ChkbO55229 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ChkbO55229 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ChkbO55229 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ChkbO55229 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ChkbO55229 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ChkbO55229 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ChkbO55229 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ChkbO55229 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ChkbO55229 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ChkbO55229 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ChkbO55229 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ChkbO55229 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ChkbO55229 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ChkbO55229 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ChkbO55229 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ChkbO55229 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ChkbO55229 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ChkbO55229 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ChkbO55229 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ChkbO55229 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ChkbO55229 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ChkbO55229 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ChkbO55229 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ChkbO55229 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ChkbO55229 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ChkbO55229 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ChkbO55229 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ChkbO55229 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ChkbO55229 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ChkbO55229 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ChkbO55229 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ChkbO55229 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ChkbO55229 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ChkbO55229 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ChkbO55229 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ChkbO55229 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ChkbO55229 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ChkbO55229 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ChkbO55229 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ChkbO55229 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ChkbO55229 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ChkbO55229 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ChkbO55229 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ChkbO55229 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ChkbO55229 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ChkbO55229 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ChkbO55229 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ChkbO55229 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ChkbO55229 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ChkbO55229 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ChkbO55229 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ChkbO55229 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ChkbO55229 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ChkbO55229 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ChkbO55229 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ChkbO55229 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ChkbO55229 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ChkbO55229 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ChkbO55229 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ChkbO55229 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ChkbO55229 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ChkbO55229 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ChkbO55229 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ChkbO55229 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ChkbO55229 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
ChkbO55229 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ChkbO55229 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ChkbO55229 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ChkbO55229 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ChkbO55229 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ChkbO55229 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ChkbO55229 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ChkbO55229 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ChkbO55229 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ChkbO55229 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ChkbO55229 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ChkbO55229 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ChkbO55229 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ChkbO55229 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ChkbO55229 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ChkbO55229 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ChkbO55229 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ChkbO55229 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ChkbO55229 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ChkbO55229 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ChkbO55229 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ChkbO55229 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
ChkbO55229 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
ChkbO55229 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ChkbO55229 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ChkbO55229 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ChkbO55229 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ChkbO55229 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ChkbO55229 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
ChkbO55229 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms