Protein–RNA interactions for Protein: O55028

Bckdk, [3-methyl-2-oxobutanoate dehydrogenase [lipoamide]] kinase, mitochondrial, mousemouse

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Length 412 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BckdkO55028 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
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BckdkO55028 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
BckdkO55028 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
BckdkO55028 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
BckdkO55028 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
BckdkO55028 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
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BckdkO55028 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
BckdkO55028 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
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BckdkO55028 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
BckdkO55028 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
BckdkO55028 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
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BckdkO55028 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
BckdkO55028 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
BckdkO55028 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
BckdkO55028 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
BckdkO55028 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
BckdkO55028 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
BckdkO55028 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
BckdkO55028 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
BckdkO55028 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
BckdkO55028 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
BckdkO55028 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
BckdkO55028 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
BckdkO55028 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
BckdkO55028 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
BckdkO55028 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
BckdkO55028 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
BckdkO55028 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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BckdkO55028 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
BckdkO55028 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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