Protein–RNA interactions for Protein: O54988

Slk, STE20-like serine/threonine-protein kinase, mousemouse

Predictions only

Length 1,233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SlkO54988 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SlkO54988 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
SlkO54988 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
SlkO54988 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SlkO54988 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SlkO54988 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SlkO54988 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SlkO54988 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SlkO54988 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SlkO54988 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SlkO54988 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SlkO54988 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SlkO54988 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
SlkO54988 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SlkO54988 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SlkO54988 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SlkO54988 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SlkO54988 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SlkO54988 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SlkO54988 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SlkO54988 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SlkO54988 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SlkO54988 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SlkO54988 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SlkO54988 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SlkO54988 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SlkO54988 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
SlkO54988 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SlkO54988 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SlkO54988 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
SlkO54988 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SlkO54988 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SlkO54988 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SlkO54988 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SlkO54988 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SlkO54988 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SlkO54988 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SlkO54988 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SlkO54988 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SlkO54988 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SlkO54988 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SlkO54988 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SlkO54988 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SlkO54988 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SlkO54988 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SlkO54988 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
SlkO54988 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SlkO54988 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SlkO54988 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SlkO54988 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SlkO54988 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SlkO54988 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SlkO54988 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SlkO54988 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
SlkO54988 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SlkO54988 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SlkO54988 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SlkO54988 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SlkO54988 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SlkO54988 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SlkO54988 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SlkO54988 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SlkO54988 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SlkO54988 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SlkO54988 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SlkO54988 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SlkO54988 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SlkO54988 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SlkO54988 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SlkO54988 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SlkO54988 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SlkO54988 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
SlkO54988 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SlkO54988 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
SlkO54988 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SlkO54988 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SlkO54988 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SlkO54988 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SlkO54988 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SlkO54988 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SlkO54988 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SlkO54988 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SlkO54988 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SlkO54988 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SlkO54988 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SlkO54988 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SlkO54988 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
SlkO54988 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
SlkO54988 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
SlkO54988 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SlkO54988 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SlkO54988 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SlkO54988 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SlkO54988 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SlkO54988 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SlkO54988 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SlkO54988 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SlkO54988 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SlkO54988 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SlkO54988 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms