Protein–RNA interactions for Protein: O35955

Psmb10, Proteasome subunit beta type-10, mousemouse

Predictions only

Length 273 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmb10O35955 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Psmb10O35955 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Psmb10O35955 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Psmb10O35955 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Psmb10O35955 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Psmb10O35955 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Psmb10O35955 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Psmb10O35955 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Psmb10O35955 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Psmb10O35955 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Psmb10O35955 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Psmb10O35955 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Psmb10O35955 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Psmb10O35955 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Psmb10O35955 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Psmb10O35955 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Psmb10O35955 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Psmb10O35955 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Psmb10O35955 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Psmb10O35955 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Psmb10O35955 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Psmb10O35955 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Psmb10O35955 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Psmb10O35955 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Psmb10O35955 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Psmb10O35955 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Psmb10O35955 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Psmb10O35955 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
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Psmb10O35955 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Psmb10O35955 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
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Psmb10O35955 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
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Psmb10O35955 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
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Psmb10O35955 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
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Psmb10O35955 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
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Psmb10O35955 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Psmb10O35955 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Psmb10O35955 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Psmb10O35955 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Psmb10O35955 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Psmb10O35955 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Psmb10O35955 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Psmb10O35955 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Psmb10O35955 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Psmb10O35955 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Psmb10O35955 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Psmb10O35955 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Psmb10O35955 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Psmb10O35955 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Psmb10O35955 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Psmb10O35955 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
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Psmb10O35955 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Psmb10O35955 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
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Psmb10O35955 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Psmb10O35955 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Psmb10O35955 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
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Psmb10O35955 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Psmb10O35955 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Psmb10O35955 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Psmb10O35955 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Psmb10O35955 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Psmb10O35955 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Psmb10O35955 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Psmb10O35955 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Psmb10O35955 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Psmb10O35955 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Psmb10O35955 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Psmb10O35955 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Psmb10O35955 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Psmb10O35955 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Psmb10O35955 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Psmb10O35955 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Psmb10O35955 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Psmb10O35955 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Psmb10O35955 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Psmb10O35955 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Psmb10O35955 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
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Psmb10O35955 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
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