Protein–RNA interactions for Protein: O35904

Pik3cd, Phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit delta isoform, mousemouse

Predictions only

Length 1,043 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pik3cdO35904 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pik3cdO35904 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pik3cdO35904 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pik3cdO35904 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pik3cdO35904 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pik3cdO35904 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pik3cdO35904 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pik3cdO35904 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pik3cdO35904 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pik3cdO35904 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pik3cdO35904 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pik3cdO35904 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pik3cdO35904 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pik3cdO35904 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pik3cdO35904 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pik3cdO35904 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pik3cdO35904 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pik3cdO35904 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pik3cdO35904 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pik3cdO35904 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pik3cdO35904 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pik3cdO35904 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pik3cdO35904 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pik3cdO35904 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pik3cdO35904 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pik3cdO35904 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pik3cdO35904 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pik3cdO35904 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pik3cdO35904 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pik3cdO35904 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Pik3cdO35904 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pik3cdO35904 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pik3cdO35904 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pik3cdO35904 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pik3cdO35904 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pik3cdO35904 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pik3cdO35904 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pik3cdO35904 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Pik3cdO35904 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pik3cdO35904 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pik3cdO35904 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pik3cdO35904 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pik3cdO35904 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pik3cdO35904 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pik3cdO35904 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pik3cdO35904 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pik3cdO35904 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pik3cdO35904 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pik3cdO35904 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pik3cdO35904 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pik3cdO35904 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pik3cdO35904 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pik3cdO35904 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pik3cdO35904 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pik3cdO35904 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pik3cdO35904 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pik3cdO35904 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Pik3cdO35904 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pik3cdO35904 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pik3cdO35904 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pik3cdO35904 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pik3cdO35904 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pik3cdO35904 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pik3cdO35904 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pik3cdO35904 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pik3cdO35904 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Pik3cdO35904 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pik3cdO35904 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pik3cdO35904 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pik3cdO35904 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Pik3cdO35904 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Pik3cdO35904 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pik3cdO35904 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pik3cdO35904 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Pik3cdO35904 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pik3cdO35904 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pik3cdO35904 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Pik3cdO35904 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pik3cdO35904 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pik3cdO35904 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pik3cdO35904 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pik3cdO35904 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pik3cdO35904 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pik3cdO35904 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pik3cdO35904 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pik3cdO35904 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pik3cdO35904 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pik3cdO35904 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pik3cdO35904 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pik3cdO35904 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pik3cdO35904 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pik3cdO35904 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pik3cdO35904 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pik3cdO35904 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pik3cdO35904 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pik3cdO35904 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pik3cdO35904 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pik3cdO35904 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Pik3cdO35904 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pik3cdO35904 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms