Protein–RNA interactions for Protein: O35892

Sp100, Nuclear autoantigen Sp-100, mousemouse

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Length 482 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sp100O35892 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Sp100O35892 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Sp100O35892 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sp100O35892 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sp100O35892 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sp100O35892 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sp100O35892 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sp100O35892 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sp100O35892 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sp100O35892 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sp100O35892 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sp100O35892 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sp100O35892 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sp100O35892 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sp100O35892 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sp100O35892 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sp100O35892 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sp100O35892 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sp100O35892 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Sp100O35892 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Sp100O35892 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Sp100O35892 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sp100O35892 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sp100O35892 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sp100O35892 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sp100O35892 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sp100O35892 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sp100O35892 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sp100O35892 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sp100O35892 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sp100O35892 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Sp100O35892 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sp100O35892 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sp100O35892 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sp100O35892 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sp100O35892 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sp100O35892 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sp100O35892 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sp100O35892 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sp100O35892 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sp100O35892 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Sp100O35892 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sp100O35892 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sp100O35892 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sp100O35892 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Sp100O35892 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Sp100O35892 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sp100O35892 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sp100O35892 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sp100O35892 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sp100O35892 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sp100O35892 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sp100O35892 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sp100O35892 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sp100O35892 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sp100O35892 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sp100O35892 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sp100O35892 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sp100O35892 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sp100O35892 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sp100O35892 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Sp100O35892 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sp100O35892 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sp100O35892 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sp100O35892 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sp100O35892 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sp100O35892 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sp100O35892 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sp100O35892 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sp100O35892 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sp100O35892 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sp100O35892 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sp100O35892 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sp100O35892 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sp100O35892 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sp100O35892 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sp100O35892 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sp100O35892 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sp100O35892 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sp100O35892 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sp100O35892 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sp100O35892 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Sp100O35892 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sp100O35892 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Sp100O35892 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Sp100O35892 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sp100O35892 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Sp100O35892 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sp100O35892 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sp100O35892 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sp100O35892 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sp100O35892 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sp100O35892 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sp100O35892 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sp100O35892 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sp100O35892 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sp100O35892 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sp100O35892 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sp100O35892 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sp100O35892 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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