Protein–RNA interactions for Protein: O35864

Cops5, COP9 signalosome complex subunit 5, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cops5O35864 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cops5O35864 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Cops5O35864 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Cops5O35864 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cops5O35864 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cops5O35864 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cops5O35864 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cops5O35864 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cops5O35864 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cops5O35864 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cops5O35864 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cops5O35864 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cops5O35864 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cops5O35864 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cops5O35864 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cops5O35864 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cops5O35864 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cops5O35864 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cops5O35864 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cops5O35864 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cops5O35864 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cops5O35864 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cops5O35864 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cops5O35864 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cops5O35864 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cops5O35864 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cops5O35864 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cops5O35864 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cops5O35864 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Cops5O35864 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Cops5O35864 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Cops5O35864 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cops5O35864 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cops5O35864 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cops5O35864 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Cops5O35864 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cops5O35864 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cops5O35864 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cops5O35864 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cops5O35864 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cops5O35864 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cops5O35864 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cops5O35864 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cops5O35864 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Cops5O35864 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cops5O35864 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cops5O35864 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cops5O35864 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cops5O35864 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cops5O35864 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cops5O35864 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cops5O35864 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cops5O35864 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cops5O35864 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cops5O35864 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Cops5O35864 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cops5O35864 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cops5O35864 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cops5O35864 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cops5O35864 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cops5O35864 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cops5O35864 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cops5O35864 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cops5O35864 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cops5O35864 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cops5O35864 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cops5O35864 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cops5O35864 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cops5O35864 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cops5O35864 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cops5O35864 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cops5O35864 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cops5O35864 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cops5O35864 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cops5O35864 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cops5O35864 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cops5O35864 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cops5O35864 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cops5O35864 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cops5O35864 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cops5O35864 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cops5O35864 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cops5O35864 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cops5O35864 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cops5O35864 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cops5O35864 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cops5O35864 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Cops5O35864 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cops5O35864 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cops5O35864 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cops5O35864 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cops5O35864 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cops5O35864 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cops5O35864 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cops5O35864 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cops5O35864 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cops5O35864 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cops5O35864 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cops5O35864 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cops5O35864 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.2 ms