Protein–RNA interactions for Protein: O35452

Tnxb, Tenascin X, mousemouse

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Length 4,006 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TnxbO35452 Mymx-201ENSMUST00000113529 442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
TnxbO35452 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
TnxbO35452 Gm9550-201ENSMUST00000161130 862 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
TnxbO35452 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
TnxbO35452 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
TnxbO35452 Gm9540-201ENSMUST00000188230 478 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
TnxbO35452 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
TnxbO35452 Gm45219-201ENSMUST00000205602 465 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
TnxbO35452 Cox6a2-201ENSMUST00000033049 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
TnxbO35452 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
TnxbO35452 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
TnxbO35452 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
TnxbO35452 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
TnxbO35452 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
TnxbO35452 Igbp1b-201ENSMUST00000054786 1456 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
TnxbO35452 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
TnxbO35452 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
TnxbO35452 Cav2-202ENSMUST00000115459 974 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
TnxbO35452 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
TnxbO35452 Gm17823-201ENSMUST00000217830 1006 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
TnxbO35452 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
TnxbO35452 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
TnxbO35452 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
TnxbO35452 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
TnxbO35452 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
TnxbO35452 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
TnxbO35452 Fbp1-201ENSMUST00000092888 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
TnxbO35452 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
TnxbO35452 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
TnxbO35452 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
TnxbO35452 Endov-204ENSMUST00000129327 1184 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
TnxbO35452 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
TnxbO35452 Tmem267-202ENSMUST00000176171 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
TnxbO35452 Gm8768-201ENSMUST00000220020 826 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
TnxbO35452 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
TnxbO35452 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
TnxbO35452 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
TnxbO35452 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
TnxbO35452 Capzb-201ENSMUST00000030518 1390 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
TnxbO35452 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
TnxbO35452 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
TnxbO35452 Cdk2ap1-204ENSMUST00000111474 1286 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
TnxbO35452 Gm27246-201ENSMUST00000183611 1240 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
TnxbO35452 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
TnxbO35452 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
TnxbO35452 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
TnxbO35452 AC136986.1-201ENSMUST00000222829 380 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
TnxbO35452 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
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TnxbO35452 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
TnxbO35452 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
TnxbO35452 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
TnxbO35452 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
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TnxbO35452 Gm15829-201ENSMUST00000145415 869 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
TnxbO35452 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
TnxbO35452 Gm27175-201ENSMUST00000183759 606 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
TnxbO35452 Gm27223-201ENSMUST00000184653 606 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
TnxbO35452 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
TnxbO35452 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
TnxbO35452 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
TnxbO35452 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
TnxbO35452 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
TnxbO35452 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
TnxbO35452 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
TnxbO35452 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
TnxbO35452 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
TnxbO35452 Vamp5-202ENSMUST00000101285 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
TnxbO35452 Prr15l-203ENSMUST00000107633 930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
TnxbO35452 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
TnxbO35452 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
TnxbO35452 Gm34045-201ENSMUST00000217700 988 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
TnxbO35452 Rab7-201ENSMUST00000095048 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
TnxbO35452 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
TnxbO35452 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
TnxbO35452 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
TnxbO35452 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
TnxbO35452 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
TnxbO35452 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
TnxbO35452 Gm16397-201ENSMUST00000122201 494 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
TnxbO35452 Bloc1s2-ps-201ENSMUST00000183232 432 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
TnxbO35452 Olfr284-202ENSMUST00000206647 966 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
TnxbO35452 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
TnxbO35452 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
TnxbO35452 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
TnxbO35452 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
TnxbO35452 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
TnxbO35452 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
TnxbO35452 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
TnxbO35452 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
TnxbO35452 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
TnxbO35452 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
TnxbO35452 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
TnxbO35452 Gm8194-201ENSMUST00000159783 859 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
TnxbO35452 Park2-204ENSMUST00000179624 1108 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
TnxbO35452 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
TnxbO35452 Gm3283-201ENSMUST00000199319 1350 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
TnxbO35452 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
TnxbO35452 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
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