Protein–RNA interactions for Protein: O35451

Atf6b, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-6 beta, mousemouse

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Length 699 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atf6bO35451 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Atf6bO35451 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Atf6bO35451 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Atf6bO35451 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Atf6bO35451 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Atf6bO35451 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Atf6bO35451 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Atf6bO35451 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Atf6bO35451 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Atf6bO35451 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Atf6bO35451 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Atf6bO35451 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Atf6bO35451 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Atf6bO35451 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Atf6bO35451 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Atf6bO35451 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
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Atf6bO35451 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Atf6bO35451 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Atf6bO35451 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Atf6bO35451 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Atf6bO35451 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Atf6bO35451 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Atf6bO35451 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Atf6bO35451 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Atf6bO35451 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Atf6bO35451 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Atf6bO35451 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Atf6bO35451 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Atf6bO35451 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
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Atf6bO35451 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Atf6bO35451 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Atf6bO35451 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Atf6bO35451 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Atf6bO35451 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Atf6bO35451 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Atf6bO35451 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Atf6bO35451 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Atf6bO35451 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Atf6bO35451 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Atf6bO35451 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Atf6bO35451 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Atf6bO35451 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Atf6bO35451 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Atf6bO35451 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Atf6bO35451 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Atf6bO35451 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Atf6bO35451 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Atf6bO35451 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Atf6bO35451 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC13.02□□□□□ -0.32
Atf6bO35451 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Atf6bO35451 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
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Atf6bO35451 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
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Atf6bO35451 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Atf6bO35451 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Atf6bO35451 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Atf6bO35451 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Atf6bO35451 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
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Atf6bO35451 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Atf6bO35451 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Atf6bO35451 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Atf6bO35451 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Atf6bO35451 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Atf6bO35451 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Atf6bO35451 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Atf6bO35451 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Atf6bO35451 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Atf6bO35451 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Atf6bO35451 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Atf6bO35451 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Atf6bO35451 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Atf6bO35451 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Atf6bO35451 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Atf6bO35451 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Atf6bO35451 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Atf6bO35451 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Atf6bO35451 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Atf6bO35451 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Atf6bO35451 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Atf6bO35451 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Atf6bO35451 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Atf6bO35451 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms