Protein–RNA interactions for Protein: O35424

H2-Ob, Histocompatibility 2, O region beta locus, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-ObO35424 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
H2-ObO35424 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
H2-ObO35424 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
H2-ObO35424 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
H2-ObO35424 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
H2-ObO35424 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
H2-ObO35424 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
H2-ObO35424 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
H2-ObO35424 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
H2-ObO35424 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
H2-ObO35424 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
H2-ObO35424 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
H2-ObO35424 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
H2-ObO35424 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
H2-ObO35424 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
H2-ObO35424 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
H2-ObO35424 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
H2-ObO35424 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
H2-ObO35424 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
H2-ObO35424 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
H2-ObO35424 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
H2-ObO35424 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
H2-ObO35424 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
H2-ObO35424 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
H2-ObO35424 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
H2-ObO35424 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
H2-ObO35424 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
H2-ObO35424 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
H2-ObO35424 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
H2-ObO35424 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
H2-ObO35424 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
H2-ObO35424 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
H2-ObO35424 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
H2-ObO35424 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
H2-ObO35424 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
H2-ObO35424 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
H2-ObO35424 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
H2-ObO35424 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
H2-ObO35424 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
H2-ObO35424 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
H2-ObO35424 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
H2-ObO35424 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
H2-ObO35424 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
H2-ObO35424 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
H2-ObO35424 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
H2-ObO35424 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
H2-ObO35424 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
H2-ObO35424 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
H2-ObO35424 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
H2-ObO35424 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
H2-ObO35424 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
H2-ObO35424 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
H2-ObO35424 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
H2-ObO35424 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
H2-ObO35424 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
H2-ObO35424 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
H2-ObO35424 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
H2-ObO35424 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
H2-ObO35424 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
H2-ObO35424 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
H2-ObO35424 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
H2-ObO35424 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
H2-ObO35424 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
H2-ObO35424 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
H2-ObO35424 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
H2-ObO35424 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
H2-ObO35424 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
H2-ObO35424 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
H2-ObO35424 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
H2-ObO35424 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
H2-ObO35424 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
H2-ObO35424 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
H2-ObO35424 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
H2-ObO35424 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
H2-ObO35424 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
H2-ObO35424 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
H2-ObO35424 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
H2-ObO35424 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
H2-ObO35424 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
H2-ObO35424 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
H2-ObO35424 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
H2-ObO35424 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
H2-ObO35424 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
H2-ObO35424 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
H2-ObO35424 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
H2-ObO35424 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
H2-ObO35424 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
H2-ObO35424 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
H2-ObO35424 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
H2-ObO35424 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
H2-ObO35424 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
H2-ObO35424 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
H2-ObO35424 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
H2-ObO35424 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
H2-ObO35424 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
H2-ObO35424 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
H2-ObO35424 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
H2-ObO35424 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
H2-ObO35424 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
H2-ObO35424 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.8 ms