Protein–RNA interactions for Protein: O35326

Srsf5, Serine/arginine-rich splicing factor 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 269 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srsf5O35326 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Srsf5O35326 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Srsf5O35326 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Srsf5O35326 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Srsf5O35326 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Srsf5O35326 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Srsf5O35326 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Srsf5O35326 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Srsf5O35326 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Srsf5O35326 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Srsf5O35326 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Srsf5O35326 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Srsf5O35326 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Srsf5O35326 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Srsf5O35326 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Srsf5O35326 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Srsf5O35326 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Srsf5O35326 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Srsf5O35326 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Srsf5O35326 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Srsf5O35326 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Srsf5O35326 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Srsf5O35326 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Srsf5O35326 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Srsf5O35326 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Srsf5O35326 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Srsf5O35326 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Srsf5O35326 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Srsf5O35326 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Srsf5O35326 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Srsf5O35326 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Srsf5O35326 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Srsf5O35326 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Srsf5O35326 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Srsf5O35326 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Srsf5O35326 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Srsf5O35326 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Srsf5O35326 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Srsf5O35326 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Srsf5O35326 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Srsf5O35326 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Srsf5O35326 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Srsf5O35326 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Srsf5O35326 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Srsf5O35326 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Srsf5O35326 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Srsf5O35326 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Srsf5O35326 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Srsf5O35326 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Srsf5O35326 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Srsf5O35326 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Srsf5O35326 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Srsf5O35326 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Srsf5O35326 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Srsf5O35326 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Srsf5O35326 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Srsf5O35326 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Srsf5O35326 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Srsf5O35326 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Srsf5O35326 Mir6420-201ENSMUST00000185032 102 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Srsf5O35326 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Srsf5O35326 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Srsf5O35326 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Srsf5O35326 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Srsf5O35326 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Srsf5O35326 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Srsf5O35326 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Srsf5O35326 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Srsf5O35326 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Srsf5O35326 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Srsf5O35326 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Srsf5O35326 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Srsf5O35326 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Srsf5O35326 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Srsf5O35326 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Srsf5O35326 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Srsf5O35326 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Srsf5O35326 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Srsf5O35326 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Srsf5O35326 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Srsf5O35326 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Srsf5O35326 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Srsf5O35326 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Srsf5O35326 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Srsf5O35326 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Srsf5O35326 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Srsf5O35326 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Srsf5O35326 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Srsf5O35326 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Srsf5O35326 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Srsf5O35326 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Srsf5O35326 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Srsf5O35326 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Srsf5O35326 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Srsf5O35326 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Srsf5O35326 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Srsf5O35326 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Srsf5O35326 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Srsf5O35326 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Srsf5O35326 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.8 ms