Protein–RNA interactions for Protein: O35214

Rrh, Visual pigment-like receptor peropsin, mousemouse

Predictions only

Length 337 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RrhO35214 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RrhO35214 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
RrhO35214 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
RrhO35214 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RrhO35214 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
RrhO35214 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RrhO35214 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RrhO35214 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
RrhO35214 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
RrhO35214 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RrhO35214 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
RrhO35214 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
RrhO35214 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
RrhO35214 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
RrhO35214 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RrhO35214 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
RrhO35214 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RrhO35214 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RrhO35214 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RrhO35214 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
RrhO35214 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RrhO35214 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RrhO35214 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RrhO35214 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RrhO35214 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RrhO35214 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RrhO35214 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RrhO35214 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
RrhO35214 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RrhO35214 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RrhO35214 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RrhO35214 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RrhO35214 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RrhO35214 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RrhO35214 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RrhO35214 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RrhO35214 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RrhO35214 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RrhO35214 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RrhO35214 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RrhO35214 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RrhO35214 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RrhO35214 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RrhO35214 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
RrhO35214 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
RrhO35214 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RrhO35214 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RrhO35214 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RrhO35214 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RrhO35214 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RrhO35214 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RrhO35214 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RrhO35214 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RrhO35214 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
RrhO35214 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RrhO35214 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RrhO35214 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RrhO35214 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RrhO35214 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RrhO35214 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RrhO35214 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RrhO35214 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RrhO35214 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RrhO35214 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RrhO35214 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RrhO35214 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RrhO35214 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
RrhO35214 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RrhO35214 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RrhO35214 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
RrhO35214 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RrhO35214 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RrhO35214 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RrhO35214 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RrhO35214 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RrhO35214 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
RrhO35214 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RrhO35214 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RrhO35214 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RrhO35214 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
RrhO35214 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RrhO35214 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
RrhO35214 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RrhO35214 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
RrhO35214 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RrhO35214 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
RrhO35214 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
RrhO35214 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
RrhO35214 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RrhO35214 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RrhO35214 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RrhO35214 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RrhO35214 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
RrhO35214 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RrhO35214 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
RrhO35214 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RrhO35214 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RrhO35214 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RrhO35214 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RrhO35214 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms