Protein–RNA interactions for Protein: O35074

Ptgis, Prostacyclin synthase, mousemouse

Predictions only

Length 501 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtgisO35074 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PtgisO35074 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PtgisO35074 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PtgisO35074 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PtgisO35074 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PtgisO35074 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PtgisO35074 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PtgisO35074 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PtgisO35074 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PtgisO35074 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PtgisO35074 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PtgisO35074 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PtgisO35074 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PtgisO35074 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PtgisO35074 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
PtgisO35074 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PtgisO35074 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PtgisO35074 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PtgisO35074 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PtgisO35074 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PtgisO35074 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PtgisO35074 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PtgisO35074 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
PtgisO35074 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PtgisO35074 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
PtgisO35074 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PtgisO35074 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
PtgisO35074 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
PtgisO35074 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PtgisO35074 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PtgisO35074 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PtgisO35074 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PtgisO35074 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PtgisO35074 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PtgisO35074 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PtgisO35074 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PtgisO35074 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PtgisO35074 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PtgisO35074 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PtgisO35074 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PtgisO35074 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PtgisO35074 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PtgisO35074 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PtgisO35074 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PtgisO35074 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PtgisO35074 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PtgisO35074 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PtgisO35074 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PtgisO35074 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
PtgisO35074 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PtgisO35074 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PtgisO35074 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PtgisO35074 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PtgisO35074 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PtgisO35074 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
PtgisO35074 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
PtgisO35074 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PtgisO35074 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PtgisO35074 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PtgisO35074 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PtgisO35074 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PtgisO35074 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PtgisO35074 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PtgisO35074 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PtgisO35074 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PtgisO35074 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PtgisO35074 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PtgisO35074 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
PtgisO35074 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PtgisO35074 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PtgisO35074 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PtgisO35074 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PtgisO35074 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PtgisO35074 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PtgisO35074 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
PtgisO35074 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PtgisO35074 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PtgisO35074 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PtgisO35074 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PtgisO35074 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PtgisO35074 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PtgisO35074 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PtgisO35074 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PtgisO35074 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PtgisO35074 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PtgisO35074 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PtgisO35074 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PtgisO35074 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PtgisO35074 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PtgisO35074 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PtgisO35074 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
PtgisO35074 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
PtgisO35074 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PtgisO35074 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PtgisO35074 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PtgisO35074 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PtgisO35074 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PtgisO35074 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PtgisO35074 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PtgisO35074 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms