Protein–RNA interactions for Protein: O35071

Kif1c, Kinesin-like protein KIF1C, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,100 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kif1cO35071 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Kif1cO35071 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Kif1cO35071 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Kif1cO35071 Mip-201ENSMUST00000026455 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Kif1cO35071 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Kif1cO35071 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Kif1cO35071 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Kif1cO35071 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Kif1cO35071 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Kif1cO35071 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Kif1cO35071 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Kif1cO35071 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Kif1cO35071 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Kif1cO35071 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Kif1cO35071 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Kif1cO35071 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Kif1cO35071 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Kif1cO35071 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Kif1cO35071 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Kif1cO35071 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Kif1cO35071 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Kif1cO35071 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Kif1cO35071 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Kif1cO35071 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Kif1cO35071 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Kif1cO35071 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Kif1cO35071 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Kif1cO35071 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Kif1cO35071 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Kif1cO35071 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Kif1cO35071 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Kif1cO35071 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Kif1cO35071 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Kif1cO35071 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Kif1cO35071 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Kif1cO35071 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Kif1cO35071 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Kif1cO35071 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Kif1cO35071 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Kif1cO35071 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Kif1cO35071 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Kif1cO35071 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Kif1cO35071 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Kif1cO35071 Rbm8a-202ENSMUST00000196456 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Kif1cO35071 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Kif1cO35071 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Kif1cO35071 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Kif1cO35071 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Kif1cO35071 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Kif1cO35071 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Kif1cO35071 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Kif1cO35071 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Kif1cO35071 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Kif1cO35071 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Kif1cO35071 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Kif1cO35071 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Kif1cO35071 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Kif1cO35071 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Kif1cO35071 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Kif1cO35071 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Kif1cO35071 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Kif1cO35071 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Kif1cO35071 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Kif1cO35071 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Kif1cO35071 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Kif1cO35071 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Kif1cO35071 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Kif1cO35071 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Kif1cO35071 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Kif1cO35071 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Kif1cO35071 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Kif1cO35071 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Kif1cO35071 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Kif1cO35071 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Kif1cO35071 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Kif1cO35071 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Kif1cO35071 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Kif1cO35071 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Kif1cO35071 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Kif1cO35071 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Kif1cO35071 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Kif1cO35071 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Kif1cO35071 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Kif1cO35071 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Kif1cO35071 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Kif1cO35071 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Kif1cO35071 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Kif1cO35071 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Kif1cO35071 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Kif1cO35071 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Kif1cO35071 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Kif1cO35071 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Kif1cO35071 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Kif1cO35071 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Kif1cO35071 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Kif1cO35071 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Kif1cO35071 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Kif1cO35071 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Kif1cO35071 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Kif1cO35071 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms