Protein–RNA interactions for Protein: O08976

Pbsn, Probasin, mousemouse

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Length 174 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PbsnO08976 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PbsnO08976 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PbsnO08976 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PbsnO08976 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PbsnO08976 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PbsnO08976 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PbsnO08976 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PbsnO08976 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PbsnO08976 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PbsnO08976 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PbsnO08976 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PbsnO08976 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PbsnO08976 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PbsnO08976 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PbsnO08976 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PbsnO08976 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
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PbsnO08976 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PbsnO08976 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PbsnO08976 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
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PbsnO08976 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
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PbsnO08976 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PbsnO08976 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PbsnO08976 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PbsnO08976 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PbsnO08976 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PbsnO08976 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PbsnO08976 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PbsnO08976 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PbsnO08976 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PbsnO08976 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PbsnO08976 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PbsnO08976 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PbsnO08976 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PbsnO08976 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PbsnO08976 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
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PbsnO08976 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PbsnO08976 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PbsnO08976 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PbsnO08976 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
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PbsnO08976 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
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PbsnO08976 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
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PbsnO08976 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PbsnO08976 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PbsnO08976 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PbsnO08976 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PbsnO08976 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
PbsnO08976 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PbsnO08976 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PbsnO08976 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PbsnO08976 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PbsnO08976 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PbsnO08976 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PbsnO08976 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms