Protein–RNA interactions for Protein: O08810

Eftud2, 116 kDa U5 small nuclear ribonucleoprotein component, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 971 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eftud2O08810 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Eftud2O08810 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Eftud2O08810 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Eftud2O08810 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Eftud2O08810 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Eftud2O08810 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Eftud2O08810 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Eftud2O08810 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Eftud2O08810 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Eftud2O08810 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Eftud2O08810 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Eftud2O08810 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Eftud2O08810 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Eftud2O08810 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Eftud2O08810 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Eftud2O08810 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Eftud2O08810 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Eftud2O08810 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Eftud2O08810 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Eftud2O08810 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Eftud2O08810 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Eftud2O08810 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Eftud2O08810 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Eftud2O08810 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Eftud2O08810 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Eftud2O08810 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Eftud2O08810 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Eftud2O08810 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Eftud2O08810 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Eftud2O08810 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Eftud2O08810 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Eftud2O08810 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Eftud2O08810 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Eftud2O08810 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Eftud2O08810 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Eftud2O08810 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Eftud2O08810 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Eftud2O08810 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Eftud2O08810 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Eftud2O08810 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Eftud2O08810 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Eftud2O08810 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Eftud2O08810 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Eftud2O08810 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Eftud2O08810 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Eftud2O08810 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Eftud2O08810 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Eftud2O08810 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Eftud2O08810 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Eftud2O08810 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Eftud2O08810 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Eftud2O08810 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Eftud2O08810 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Eftud2O08810 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Eftud2O08810 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Eftud2O08810 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Eftud2O08810 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Eftud2O08810 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Eftud2O08810 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Eftud2O08810 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Eftud2O08810 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Eftud2O08810 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Eftud2O08810 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Eftud2O08810 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Eftud2O08810 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Eftud2O08810 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Eftud2O08810 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Eftud2O08810 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Eftud2O08810 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Eftud2O08810 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Eftud2O08810 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Eftud2O08810 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Eftud2O08810 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Eftud2O08810 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Eftud2O08810 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Eftud2O08810 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Eftud2O08810 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Eftud2O08810 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Eftud2O08810 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Eftud2O08810 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Eftud2O08810 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Eftud2O08810 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Eftud2O08810 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Eftud2O08810 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Eftud2O08810 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Eftud2O08810 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Eftud2O08810 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Eftud2O08810 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Eftud2O08810 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Eftud2O08810 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Eftud2O08810 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Eftud2O08810 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Eftud2O08810 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Eftud2O08810 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Eftud2O08810 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Eftud2O08810 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Eftud2O08810 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Eftud2O08810 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Eftud2O08810 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Eftud2O08810 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.3 ms