Protein–RNA interactions for Protein: O08585

Clta, Clathrin light chain A, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CltaO08585 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CltaO08585 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CltaO08585 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CltaO08585 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CltaO08585 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CltaO08585 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
CltaO08585 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CltaO08585 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CltaO08585 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CltaO08585 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CltaO08585 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CltaO08585 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CltaO08585 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CltaO08585 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CltaO08585 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CltaO08585 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
CltaO08585 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
CltaO08585 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CltaO08585 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CltaO08585 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CltaO08585 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CltaO08585 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CltaO08585 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CltaO08585 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CltaO08585 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CltaO08585 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.51
CltaO08585 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CltaO08585 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CltaO08585 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CltaO08585 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CltaO08585 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CltaO08585 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CltaO08585 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CltaO08585 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
CltaO08585 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
CltaO08585 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CltaO08585 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CltaO08585 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CltaO08585 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
CltaO08585 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CltaO08585 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CltaO08585 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CltaO08585 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CltaO08585 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
CltaO08585 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CltaO08585 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CltaO08585 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CltaO08585 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CltaO08585 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CltaO08585 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CltaO08585 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CltaO08585 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CltaO08585 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CltaO08585 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CltaO08585 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CltaO08585 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CltaO08585 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CltaO08585 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CltaO08585 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CltaO08585 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CltaO08585 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CltaO08585 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CltaO08585 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CltaO08585 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CltaO08585 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CltaO08585 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CltaO08585 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CltaO08585 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CltaO08585 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CltaO08585 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CltaO08585 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CltaO08585 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CltaO08585 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CltaO08585 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CltaO08585 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CltaO08585 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CltaO08585 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CltaO08585 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CltaO08585 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CltaO08585 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CltaO08585 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CltaO08585 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CltaO08585 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CltaO08585 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CltaO08585 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CltaO08585 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CltaO08585 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CltaO08585 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CltaO08585 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CltaO08585 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CltaO08585 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CltaO08585 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CltaO08585 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CltaO08585 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CltaO08585 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CltaO08585 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CltaO08585 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CltaO08585 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CltaO08585 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CltaO08585 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
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