Protein–RNA interactions for Protein: O08547

Sec22b, Vesicle-trafficking protein SEC22b, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 215 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec22bO08547 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Sec22bO08547 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Sec22bO08547 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Sec22bO08547 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Sec22bO08547 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Sec22bO08547 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Sec22bO08547 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Sec22bO08547 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Sec22bO08547 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Sec22bO08547 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Sec22bO08547 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Sec22bO08547 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Sec22bO08547 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Sec22bO08547 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Sec22bO08547 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Sec22bO08547 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Sec22bO08547 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sec22bO08547 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sec22bO08547 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sec22bO08547 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sec22bO08547 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sec22bO08547 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sec22bO08547 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sec22bO08547 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sec22bO08547 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sec22bO08547 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sec22bO08547 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sec22bO08547 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sec22bO08547 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sec22bO08547 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sec22bO08547 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sec22bO08547 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Sec22bO08547 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Sec22bO08547 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sec22bO08547 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sec22bO08547 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sec22bO08547 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sec22bO08547 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sec22bO08547 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sec22bO08547 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sec22bO08547 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sec22bO08547 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sec22bO08547 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Sec22bO08547 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Sec22bO08547 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Sec22bO08547 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Sec22bO08547 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Sec22bO08547 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Sec22bO08547 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Sec22bO08547 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Sec22bO08547 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Sec22bO08547 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Sec22bO08547 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Sec22bO08547 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Sec22bO08547 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Sec22bO08547 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Sec22bO08547 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Sec22bO08547 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Sec22bO08547 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Sec22bO08547 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Sec22bO08547 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Sec22bO08547 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Sec22bO08547 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Sec22bO08547 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Sec22bO08547 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Sec22bO08547 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Sec22bO08547 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Sec22bO08547 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Sec22bO08547 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Sec22bO08547 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Sec22bO08547 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Sec22bO08547 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Sec22bO08547 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Sec22bO08547 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Sec22bO08547 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Sec22bO08547 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Sec22bO08547 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Sec22bO08547 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Sec22bO08547 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Sec22bO08547 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Sec22bO08547 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Sec22bO08547 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Sec22bO08547 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Sec22bO08547 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Sec22bO08547 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Sec22bO08547 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Sec22bO08547 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Sec22bO08547 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Sec22bO08547 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Sec22bO08547 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Sec22bO08547 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Sec22bO08547 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Sec22bO08547 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Sec22bO08547 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Sec22bO08547 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Sec22bO08547 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Sec22bO08547 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Sec22bO08547 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Sec22bO08547 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Sec22bO08547 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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