Protein–RNA interactions for Protein: K7N746

Gm2888, Predicted gene 2888, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2888K7N746 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm2888K7N746 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm2888K7N746 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm2888K7N746 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm2888K7N746 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm2888K7N746 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm2888K7N746 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm2888K7N746 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm2888K7N746 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm2888K7N746 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm2888K7N746 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm2888K7N746 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm2888K7N746 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm2888K7N746 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm2888K7N746 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm2888K7N746 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm2888K7N746 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm2888K7N746 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm2888K7N746 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm2888K7N746 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm2888K7N746 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm2888K7N746 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm2888K7N746 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm2888K7N746 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm2888K7N746 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm2888K7N746 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm2888K7N746 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm2888K7N746 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm2888K7N746 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm2888K7N746 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm2888K7N746 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm2888K7N746 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm2888K7N746 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm2888K7N746 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm2888K7N746 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm2888K7N746 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm2888K7N746 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm2888K7N746 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm2888K7N746 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm2888K7N746 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm2888K7N746 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm2888K7N746 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm2888K7N746 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm2888K7N746 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm2888K7N746 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm2888K7N746 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm2888K7N746 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm2888K7N746 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm2888K7N746 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm2888K7N746 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm2888K7N746 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm2888K7N746 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm2888K7N746 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm2888K7N746 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm2888K7N746 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm2888K7N746 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm2888K7N746 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm2888K7N746 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm2888K7N746 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm2888K7N746 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm2888K7N746 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm2888K7N746 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm2888K7N746 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm2888K7N746 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm2888K7N746 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm2888K7N746 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm2888K7N746 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm2888K7N746 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm2888K7N746 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm2888K7N746 Gm22065-201ENSMUST00000103753 110 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
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Gm2888K7N746 Gm24932-201ENSMUST00000103763 110 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm2888K7N746 Gm24115-201ENSMUST00000103799 110 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
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Gm2888K7N746 Gm22191-201ENSMUST00000103831 110 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm2888K7N746 Gm24721-201ENSMUST00000103849 110 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm2888K7N746 Gm28018-201ENSMUST00000103869 110 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm2888K7N746 Gm26399-201ENSMUST00000103937 110 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm2888K7N746 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm2888K7N746 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm2888K7N746 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm2888K7N746 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm2888K7N746 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm2888K7N746 Gm25349-201ENSMUST00000177728 110 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm2888K7N746 Gm23616-201ENSMUST00000177797 110 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm2888K7N746 Gm25871-201ENSMUST00000177816 110 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm2888K7N746 Gm24752-201ENSMUST00000178240 110 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm2888K7N746 Gm24496-201ENSMUST00000178287 110 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm2888K7N746 Gm25649-201ENSMUST00000178476 110 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm2888K7N746 Gm25548-201ENSMUST00000178681 110 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm2888K7N746 Gm23147-201ENSMUST00000178841 110 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm2888K7N746 Gm26095-201ENSMUST00000179270 110 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm2888K7N746 Gm22171-201ENSMUST00000179283 110 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm2888K7N746 Gm23936-201ENSMUST00000179354 110 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm2888K7N746 Gm22619-201ENSMUST00000179516 110 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm2888K7N746 Gm25255-201ENSMUST00000179579 110 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm2888K7N746 Gm24755-201ENSMUST00000179691 110 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm2888K7N746 Gm26506-201ENSMUST00000179692 110 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm2888K7N746 Gm25086-201ENSMUST00000179931 110 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm2888K7N746 Gm23243-201ENSMUST00000180047 110 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms