Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ02

Gm2056, Predicted gene 2056, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2056J3QQ02 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gm2056J3QQ02 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Gm2056J3QQ02 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Gm2056J3QQ02 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Gm2056J3QQ02 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Gm2056J3QQ02 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gm2056J3QQ02 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gm2056J3QQ02 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gm2056J3QQ02 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gm2056J3QQ02 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gm2056J3QQ02 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gm2056J3QQ02 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gm2056J3QQ02 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gm2056J3QQ02 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gm2056J3QQ02 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gm2056J3QQ02 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gm2056J3QQ02 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gm2056J3QQ02 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gm2056J3QQ02 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gm2056J3QQ02 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gm2056J3QQ02 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gm2056J3QQ02 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gm2056J3QQ02 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gm2056J3QQ02 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gm2056J3QQ02 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gm2056J3QQ02 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gm2056J3QQ02 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gm2056J3QQ02 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm2056J3QQ02 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm2056J3QQ02 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm2056J3QQ02 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm2056J3QQ02 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm2056J3QQ02 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm2056J3QQ02 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm2056J3QQ02 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm2056J3QQ02 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm2056J3QQ02 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm2056J3QQ02 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm2056J3QQ02 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm2056J3QQ02 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm2056J3QQ02 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm2056J3QQ02 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm2056J3QQ02 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm2056J3QQ02 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm2056J3QQ02 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm2056J3QQ02 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm2056J3QQ02 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm2056J3QQ02 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm2056J3QQ02 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm2056J3QQ02 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm2056J3QQ02 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm2056J3QQ02 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm2056J3QQ02 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm2056J3QQ02 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm2056J3QQ02 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm2056J3QQ02 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm2056J3QQ02 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm2056J3QQ02 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm2056J3QQ02 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm2056J3QQ02 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm2056J3QQ02 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm2056J3QQ02 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gm2056J3QQ02 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gm2056J3QQ02 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gm2056J3QQ02 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gm2056J3QQ02 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gm2056J3QQ02 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gm2056J3QQ02 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gm2056J3QQ02 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gm2056J3QQ02 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gm2056J3QQ02 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gm2056J3QQ02 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gm2056J3QQ02 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gm2056J3QQ02 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gm2056J3QQ02 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gm2056J3QQ02 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gm2056J3QQ02 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gm2056J3QQ02 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Gm2056J3QQ02 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gm2056J3QQ02 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Gm2056J3QQ02 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gm2056J3QQ02 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gm2056J3QQ02 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gm2056J3QQ02 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gm2056J3QQ02 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Gm2056J3QQ02 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gm2056J3QQ02 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gm2056J3QQ02 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gm2056J3QQ02 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gm2056J3QQ02 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gm2056J3QQ02 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gm2056J3QQ02 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gm2056J3QQ02 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gm2056J3QQ02 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gm2056J3QQ02 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gm2056J3QQ02 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gm2056J3QQ02 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gm2056J3QQ02 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gm2056J3QQ02 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gm2056J3QQ02 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.5 ms