Protein–RNA interactions for Protein: J3QPL3

Gm5225, Predicted gene 5225, mousemouse

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Length 108 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5225J3QPL3 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm5225J3QPL3 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm5225J3QPL3 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm5225J3QPL3 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm5225J3QPL3 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm5225J3QPL3 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm5225J3QPL3 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm5225J3QPL3 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm5225J3QPL3 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm5225J3QPL3 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm5225J3QPL3 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm5225J3QPL3 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm5225J3QPL3 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm5225J3QPL3 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm5225J3QPL3 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm5225J3QPL3 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm5225J3QPL3 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm5225J3QPL3 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm5225J3QPL3 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm5225J3QPL3 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm5225J3QPL3 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm5225J3QPL3 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm5225J3QPL3 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm5225J3QPL3 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm5225J3QPL3 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm5225J3QPL3 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm5225J3QPL3 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm5225J3QPL3 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm5225J3QPL3 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm5225J3QPL3 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm5225J3QPL3 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm5225J3QPL3 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm5225J3QPL3 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm5225J3QPL3 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm5225J3QPL3 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm5225J3QPL3 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm5225J3QPL3 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm5225J3QPL3 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm5225J3QPL3 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm5225J3QPL3 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm5225J3QPL3 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm5225J3QPL3 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm5225J3QPL3 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm5225J3QPL3 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm5225J3QPL3 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm5225J3QPL3 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm5225J3QPL3 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm5225J3QPL3 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm5225J3QPL3 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm5225J3QPL3 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm5225J3QPL3 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm5225J3QPL3 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm5225J3QPL3 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm5225J3QPL3 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm5225J3QPL3 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm5225J3QPL3 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm5225J3QPL3 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm5225J3QPL3 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm5225J3QPL3 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm5225J3QPL3 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm5225J3QPL3 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm5225J3QPL3 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm5225J3QPL3 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm5225J3QPL3 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm5225J3QPL3 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm5225J3QPL3 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm5225J3QPL3 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm5225J3QPL3 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm5225J3QPL3 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm5225J3QPL3 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm5225J3QPL3 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm5225J3QPL3 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm5225J3QPL3 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm5225J3QPL3 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm5225J3QPL3 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm5225J3QPL3 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm5225J3QPL3 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm5225J3QPL3 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm5225J3QPL3 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm5225J3QPL3 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm5225J3QPL3 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm5225J3QPL3 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm5225J3QPL3 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm5225J3QPL3 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm5225J3QPL3 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm5225J3QPL3 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm5225J3QPL3 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm5225J3QPL3 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm5225J3QPL3 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm5225J3QPL3 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm5225J3QPL3 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm5225J3QPL3 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm5225J3QPL3 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm5225J3QPL3 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm5225J3QPL3 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm5225J3QPL3 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm5225J3QPL3 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm5225J3QPL3 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm5225J3QPL3 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm5225J3QPL3 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
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