Protein–RNA interactions for Protein: J3QMM8

Gm7971, Predicted gene 16429, mousemouse

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Length 481 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm7971J3QMM8 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm7971J3QMM8 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm7971J3QMM8 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm7971J3QMM8 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm7971J3QMM8 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm7971J3QMM8 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm7971J3QMM8 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm7971J3QMM8 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm7971J3QMM8 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm7971J3QMM8 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm7971J3QMM8 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm7971J3QMM8 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm7971J3QMM8 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm7971J3QMM8 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm7971J3QMM8 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm7971J3QMM8 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm7971J3QMM8 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm7971J3QMM8 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm7971J3QMM8 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm7971J3QMM8 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Gm7971J3QMM8 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm7971J3QMM8 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm7971J3QMM8 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm7971J3QMM8 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm7971J3QMM8 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm7971J3QMM8 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm7971J3QMM8 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm7971J3QMM8 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm7971J3QMM8 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm7971J3QMM8 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm7971J3QMM8 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm7971J3QMM8 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm7971J3QMM8 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm7971J3QMM8 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm7971J3QMM8 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm7971J3QMM8 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm7971J3QMM8 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm7971J3QMM8 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm7971J3QMM8 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Gm7971J3QMM8 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Gm7971J3QMM8 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm7971J3QMM8 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm7971J3QMM8 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm7971J3QMM8 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm7971J3QMM8 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Gm7971J3QMM8 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm7971J3QMM8 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Gm7971J3QMM8 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm7971J3QMM8 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm7971J3QMM8 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm7971J3QMM8 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Gm7971J3QMM8 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm7971J3QMM8 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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Gm7971J3QMM8 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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Gm7971J3QMM8 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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Gm7971J3QMM8 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm7971J3QMM8 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
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Gm7971J3QMM8 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm7971J3QMM8 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm7971J3QMM8 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm7971J3QMM8 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm7971J3QMM8 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm7971J3QMM8 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm7971J3QMM8 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm7971J3QMM8 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm7971J3QMM8 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm7971J3QMM8 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm7971J3QMM8 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm7971J3QMM8 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm7971J3QMM8 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm7971J3QMM8 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm7971J3QMM8 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm7971J3QMM8 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm7971J3QMM8 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm7971J3QMM8 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm7971J3QMM8 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm7971J3QMM8 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm7971J3QMM8 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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