Protein–RNA interactions for Protein: J3QK56

4930544D05Rik, RIKEN cDNA 4930544D05 gene, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930544D05RikJ3QK56 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
4930544D05RikJ3QK56 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
4930544D05RikJ3QK56 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
4930544D05RikJ3QK56 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
4930544D05RikJ3QK56 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
4930544D05RikJ3QK56 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
4930544D05RikJ3QK56 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
4930544D05RikJ3QK56 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
4930544D05RikJ3QK56 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
4930544D05RikJ3QK56 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
4930544D05RikJ3QK56 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
4930544D05RikJ3QK56 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC16■□□□□ 0.15
4930544D05RikJ3QK56 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC16■□□□□ 0.15
4930544D05RikJ3QK56 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
4930544D05RikJ3QK56 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
4930544D05RikJ3QK56 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
4930544D05RikJ3QK56 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
4930544D05RikJ3QK56 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
4930544D05RikJ3QK56 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
4930544D05RikJ3QK56 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
4930544D05RikJ3QK56 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC16■□□□□ 0.15
4930544D05RikJ3QK56 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC16■□□□□ 0.15
4930544D05RikJ3QK56 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
4930544D05RikJ3QK56 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
4930544D05RikJ3QK56 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
4930544D05RikJ3QK56 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
4930544D05RikJ3QK56 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC16■□□□□ 0.15
4930544D05RikJ3QK56 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
4930544D05RikJ3QK56 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
4930544D05RikJ3QK56 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
4930544D05RikJ3QK56 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
4930544D05RikJ3QK56 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
4930544D05RikJ3QK56 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
4930544D05RikJ3QK56 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
4930544D05RikJ3QK56 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
4930544D05RikJ3QK56 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
4930544D05RikJ3QK56 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
4930544D05RikJ3QK56 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
4930544D05RikJ3QK56 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
4930544D05RikJ3QK56 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
4930544D05RikJ3QK56 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
4930544D05RikJ3QK56 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
4930544D05RikJ3QK56 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
4930544D05RikJ3QK56 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
4930544D05RikJ3QK56 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
4930544D05RikJ3QK56 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
4930544D05RikJ3QK56 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
4930544D05RikJ3QK56 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
4930544D05RikJ3QK56 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
4930544D05RikJ3QK56 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
4930544D05RikJ3QK56 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
4930544D05RikJ3QK56 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
4930544D05RikJ3QK56 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
4930544D05RikJ3QK56 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
4930544D05RikJ3QK56 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
4930544D05RikJ3QK56 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
4930544D05RikJ3QK56 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
4930544D05RikJ3QK56 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
4930544D05RikJ3QK56 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
4930544D05RikJ3QK56 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
4930544D05RikJ3QK56 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
4930544D05RikJ3QK56 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
4930544D05RikJ3QK56 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
4930544D05RikJ3QK56 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
4930544D05RikJ3QK56 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
4930544D05RikJ3QK56 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
4930544D05RikJ3QK56 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
4930544D05RikJ3QK56 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
4930544D05RikJ3QK56 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
4930544D05RikJ3QK56 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
4930544D05RikJ3QK56 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
4930544D05RikJ3QK56 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
4930544D05RikJ3QK56 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
4930544D05RikJ3QK56 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
4930544D05RikJ3QK56 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
4930544D05RikJ3QK56 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
4930544D05RikJ3QK56 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
4930544D05RikJ3QK56 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
4930544D05RikJ3QK56 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
4930544D05RikJ3QK56 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
4930544D05RikJ3QK56 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
4930544D05RikJ3QK56 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
4930544D05RikJ3QK56 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
4930544D05RikJ3QK56 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
4930544D05RikJ3QK56 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
4930544D05RikJ3QK56 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
4930544D05RikJ3QK56 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
4930544D05RikJ3QK56 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
4930544D05RikJ3QK56 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
4930544D05RikJ3QK56 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
4930544D05RikJ3QK56 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
4930544D05RikJ3QK56 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
4930544D05RikJ3QK56 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
4930544D05RikJ3QK56 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
4930544D05RikJ3QK56 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
4930544D05RikJ3QK56 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
4930544D05RikJ3QK56 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
4930544D05RikJ3QK56 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
4930544D05RikJ3QK56 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
4930544D05RikJ3QK56 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.2 ms