Protein–RNA interactions for Protein: J3KML6

Gm20830, Predicted gene, 20830, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20830J3KML6 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
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Gm20830J3KML6 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Gm20830J3KML6 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Gm20830J3KML6 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Gm20830J3KML6 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Gm20830J3KML6 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Gm20830J3KML6 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Gm20830J3KML6 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Gm20830J3KML6 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Gm20830J3KML6 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Gm20830J3KML6 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Gm20830J3KML6 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Gm20830J3KML6 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm20830J3KML6 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm20830J3KML6 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm20830J3KML6 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm20830J3KML6 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm20830J3KML6 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm20830J3KML6 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm20830J3KML6 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm20830J3KML6 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm20830J3KML6 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm20830J3KML6 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm20830J3KML6 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm20830J3KML6 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm20830J3KML6 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm20830J3KML6 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC12.26□□□□□ -0.45
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Gm20830J3KML6 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm20830J3KML6 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm20830J3KML6 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm20830J3KML6 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm20830J3KML6 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
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Gm20830J3KML6 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm20830J3KML6 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
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Gm20830J3KML6 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm20830J3KML6 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
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Gm20830J3KML6 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm20830J3KML6 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm20830J3KML6 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm20830J3KML6 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm20830J3KML6 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm20830J3KML6 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm20830J3KML6 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm20830J3KML6 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm20830J3KML6 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm20830J3KML6 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm20830J3KML6 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm20830J3KML6 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm20830J3KML6 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm20830J3KML6 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm20830J3KML6 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm20830J3KML6 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm20830J3KML6 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
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Gm20830J3KML6 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
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Gm20830J3KML6 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
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Gm20830J3KML6 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
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Gm20830J3KML6 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm20830J3KML6 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm20830J3KML6 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm20830J3KML6 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm20830J3KML6 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm20830J3KML6 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm20830J3KML6 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm20830J3KML6 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm20830J3KML6 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm20830J3KML6 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm20830J3KML6 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm20830J3KML6 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm20830J3KML6 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm20830J3KML6 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm20830J3KML6 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm20830J3KML6 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm20830J3KML6 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm20830J3KML6 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm20830J3KML6 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm20830J3KML6 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm20830J3KML6 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm20830J3KML6 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm20830J3KML6 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm20830J3KML6 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
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