Protein–RNA interactions for Protein: H7BX78

Zfp408, Zinc finger protein 408, mousemouse

Predictions only

Length 710 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp408H7BX78 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Zfp408H7BX78 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Zfp408H7BX78 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Zfp408H7BX78 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Zfp408H7BX78 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zfp408H7BX78 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zfp408H7BX78 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zfp408H7BX78 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zfp408H7BX78 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zfp408H7BX78 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zfp408H7BX78 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zfp408H7BX78 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zfp408H7BX78 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Zfp408H7BX78 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Zfp408H7BX78 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zfp408H7BX78 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zfp408H7BX78 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zfp408H7BX78 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zfp408H7BX78 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zfp408H7BX78 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zfp408H7BX78 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zfp408H7BX78 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zfp408H7BX78 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zfp408H7BX78 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zfp408H7BX78 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zfp408H7BX78 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zfp408H7BX78 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zfp408H7BX78 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zfp408H7BX78 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zfp408H7BX78 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zfp408H7BX78 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zfp408H7BX78 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zfp408H7BX78 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Zfp408H7BX78 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Zfp408H7BX78 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Zfp408H7BX78 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Zfp408H7BX78 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Zfp408H7BX78 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Zfp408H7BX78 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Zfp408H7BX78 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Zfp408H7BX78 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Zfp408H7BX78 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Zfp408H7BX78 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Zfp408H7BX78 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Zfp408H7BX78 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Zfp408H7BX78 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Zfp408H7BX78 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Zfp408H7BX78 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Zfp408H7BX78 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Zfp408H7BX78 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Zfp408H7BX78 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Zfp408H7BX78 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Zfp408H7BX78 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Zfp408H7BX78 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Zfp408H7BX78 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Zfp408H7BX78 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Zfp408H7BX78 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Zfp408H7BX78 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Zfp408H7BX78 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Zfp408H7BX78 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Zfp408H7BX78 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Zfp408H7BX78 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Zfp408H7BX78 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Zfp408H7BX78 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Zfp408H7BX78 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Zfp408H7BX78 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Zfp408H7BX78 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Zfp408H7BX78 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Zfp408H7BX78 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Zfp408H7BX78 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Zfp408H7BX78 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Zfp408H7BX78 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Zfp408H7BX78 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Zfp408H7BX78 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Zfp408H7BX78 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Zfp408H7BX78 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Zfp408H7BX78 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Zfp408H7BX78 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Zfp408H7BX78 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Zfp408H7BX78 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Zfp408H7BX78 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Zfp408H7BX78 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Zfp408H7BX78 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Zfp408H7BX78 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Zfp408H7BX78 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Zfp408H7BX78 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Zfp408H7BX78 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Zfp408H7BX78 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Zfp408H7BX78 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Zfp408H7BX78 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Zfp408H7BX78 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Zfp408H7BX78 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Zfp408H7BX78 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Zfp408H7BX78 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Zfp408H7BX78 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Zfp408H7BX78 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Zfp408H7BX78 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Zfp408H7BX78 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Zfp408H7BX78 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Zfp408H7BX78 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms