Protein–RNA interactions for Protein: H3BIW7

Gm29394, Predicted gene 29394, mousemouse

Predictions only

Length 199 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm29394H3BIW7 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm29394H3BIW7 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm29394H3BIW7 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm29394H3BIW7 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm29394H3BIW7 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm29394H3BIW7 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm29394H3BIW7 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm29394H3BIW7 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm29394H3BIW7 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm29394H3BIW7 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm29394H3BIW7 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm29394H3BIW7 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm29394H3BIW7 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm29394H3BIW7 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm29394H3BIW7 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm29394H3BIW7 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm29394H3BIW7 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm29394H3BIW7 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm29394H3BIW7 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm29394H3BIW7 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm29394H3BIW7 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm29394H3BIW7 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm29394H3BIW7 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm29394H3BIW7 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm29394H3BIW7 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm29394H3BIW7 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm29394H3BIW7 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm29394H3BIW7 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm29394H3BIW7 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm29394H3BIW7 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm29394H3BIW7 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm29394H3BIW7 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm29394H3BIW7 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm29394H3BIW7 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm29394H3BIW7 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm29394H3BIW7 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm29394H3BIW7 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm29394H3BIW7 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm29394H3BIW7 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm29394H3BIW7 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm29394H3BIW7 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm29394H3BIW7 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm29394H3BIW7 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm29394H3BIW7 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm29394H3BIW7 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm29394H3BIW7 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm29394H3BIW7 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm29394H3BIW7 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm29394H3BIW7 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm29394H3BIW7 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm29394H3BIW7 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm29394H3BIW7 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm29394H3BIW7 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm29394H3BIW7 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm29394H3BIW7 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm29394H3BIW7 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm29394H3BIW7 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm29394H3BIW7 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm29394H3BIW7 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm29394H3BIW7 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm29394H3BIW7 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm29394H3BIW7 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm29394H3BIW7 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm29394H3BIW7 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm29394H3BIW7 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm29394H3BIW7 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm29394H3BIW7 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm29394H3BIW7 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm29394H3BIW7 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm29394H3BIW7 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm29394H3BIW7 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm29394H3BIW7 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm29394H3BIW7 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm29394H3BIW7 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm29394H3BIW7 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm29394H3BIW7 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm29394H3BIW7 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm29394H3BIW7 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm29394H3BIW7 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm29394H3BIW7 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm29394H3BIW7 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm29394H3BIW7 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm29394H3BIW7 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm29394H3BIW7 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm29394H3BIW7 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm29394H3BIW7 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm29394H3BIW7 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm29394H3BIW7 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm29394H3BIW7 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm29394H3BIW7 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm29394H3BIW7 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm29394H3BIW7 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm29394H3BIW7 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm29394H3BIW7 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm29394H3BIW7 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm29394H3BIW7 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm29394H3BIW7 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm29394H3BIW7 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm29394H3BIW7 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm29394H3BIW7 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.7 ms