Protein–RNA interactions for Protein: G5E8I7

Usp17lc, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein C, mousemouse

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Length 545 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp17lcG5E8I7 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Usp17lcG5E8I7 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Usp17lcG5E8I7 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Usp17lcG5E8I7 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Usp17lcG5E8I7 Mir1938-201ENSMUST00000158746 100 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Usp17lcG5E8I7 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Usp17lcG5E8I7 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Usp17lcG5E8I7 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Usp17lcG5E8I7 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Usp17lcG5E8I7 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Usp17lcG5E8I7 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Usp17lcG5E8I7 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Usp17lcG5E8I7 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Usp17lcG5E8I7 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Usp17lcG5E8I7 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Usp17lcG5E8I7 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Usp17lcG5E8I7 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Usp17lcG5E8I7 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Usp17lcG5E8I7 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Usp17lcG5E8I7 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Usp17lcG5E8I7 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Usp17lcG5E8I7 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Usp17lcG5E8I7 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Usp17lcG5E8I7 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Usp17lcG5E8I7 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Usp17lcG5E8I7 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Usp17lcG5E8I7 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Usp17lcG5E8I7 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Usp17lcG5E8I7 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Usp17lcG5E8I7 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Usp17lcG5E8I7 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Usp17lcG5E8I7 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Usp17lcG5E8I7 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Usp17lcG5E8I7 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Usp17lcG5E8I7 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Usp17lcG5E8I7 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Usp17lcG5E8I7 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Usp17lcG5E8I7 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Usp17lcG5E8I7 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Usp17lcG5E8I7 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Usp17lcG5E8I7 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Usp17lcG5E8I7 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Usp17lcG5E8I7 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Usp17lcG5E8I7 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Usp17lcG5E8I7 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Usp17lcG5E8I7 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Usp17lcG5E8I7 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Usp17lcG5E8I7 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Usp17lcG5E8I7 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Usp17lcG5E8I7 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Usp17lcG5E8I7 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Usp17lcG5E8I7 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Usp17lcG5E8I7 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Usp17lcG5E8I7 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
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Usp17lcG5E8I7 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Usp17lcG5E8I7 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Usp17lcG5E8I7 Gas5-210ENSMUST00000159706 557 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Usp17lcG5E8I7 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
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Usp17lcG5E8I7 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
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Usp17lcG5E8I7 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
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Usp17lcG5E8I7 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Usp17lcG5E8I7 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Usp17lcG5E8I7 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
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Usp17lcG5E8I7 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Usp17lcG5E8I7 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Usp17lcG5E8I7 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Usp17lcG5E8I7 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Usp17lcG5E8I7 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Usp17lcG5E8I7 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Usp17lcG5E8I7 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Usp17lcG5E8I7 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Usp17lcG5E8I7 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Usp17lcG5E8I7 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Usp17lcG5E8I7 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Usp17lcG5E8I7 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Usp17lcG5E8I7 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Usp17lcG5E8I7 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Usp17lcG5E8I7 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Usp17lcG5E8I7 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Usp17lcG5E8I7 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Usp17lcG5E8I7 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Usp17lcG5E8I7 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Usp17lcG5E8I7 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Usp17lcG5E8I7 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Usp17lcG5E8I7 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Usp17lcG5E8I7 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Usp17lcG5E8I7 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Usp17lcG5E8I7 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Usp17lcG5E8I7 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Usp17lcG5E8I7 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Usp17lcG5E8I7 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Usp17lcG5E8I7 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Usp17lcG5E8I7 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Usp17lcG5E8I7 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
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