Protein–RNA interactions for Protein: F8VPK8

Pcdh9, Protocadherin 9, mousemouse

Predictions only

Length 1,237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcdh9F8VPK8 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Pcdh9F8VPK8 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pcdh9F8VPK8 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pcdh9F8VPK8 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pcdh9F8VPK8 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pcdh9F8VPK8 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pcdh9F8VPK8 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pcdh9F8VPK8 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Pcdh9F8VPK8 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pcdh9F8VPK8 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pcdh9F8VPK8 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pcdh9F8VPK8 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pcdh9F8VPK8 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pcdh9F8VPK8 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pcdh9F8VPK8 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pcdh9F8VPK8 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pcdh9F8VPK8 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pcdh9F8VPK8 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pcdh9F8VPK8 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pcdh9F8VPK8 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pcdh9F8VPK8 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pcdh9F8VPK8 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pcdh9F8VPK8 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pcdh9F8VPK8 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pcdh9F8VPK8 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pcdh9F8VPK8 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pcdh9F8VPK8 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Pcdh9F8VPK8 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pcdh9F8VPK8 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pcdh9F8VPK8 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Pcdh9F8VPK8 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pcdh9F8VPK8 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pcdh9F8VPK8 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pcdh9F8VPK8 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pcdh9F8VPK8 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pcdh9F8VPK8 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Pcdh9F8VPK8 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pcdh9F8VPK8 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pcdh9F8VPK8 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pcdh9F8VPK8 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pcdh9F8VPK8 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pcdh9F8VPK8 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pcdh9F8VPK8 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pcdh9F8VPK8 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pcdh9F8VPK8 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pcdh9F8VPK8 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pcdh9F8VPK8 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pcdh9F8VPK8 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pcdh9F8VPK8 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pcdh9F8VPK8 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pcdh9F8VPK8 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pcdh9F8VPK8 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pcdh9F8VPK8 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pcdh9F8VPK8 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Pcdh9F8VPK8 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pcdh9F8VPK8 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pcdh9F8VPK8 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pcdh9F8VPK8 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Pcdh9F8VPK8 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pcdh9F8VPK8 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Pcdh9F8VPK8 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pcdh9F8VPK8 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pcdh9F8VPK8 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pcdh9F8VPK8 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pcdh9F8VPK8 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pcdh9F8VPK8 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pcdh9F8VPK8 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pcdh9F8VPK8 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pcdh9F8VPK8 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pcdh9F8VPK8 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pcdh9F8VPK8 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pcdh9F8VPK8 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pcdh9F8VPK8 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pcdh9F8VPK8 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pcdh9F8VPK8 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pcdh9F8VPK8 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Pcdh9F8VPK8 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Pcdh9F8VPK8 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pcdh9F8VPK8 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Pcdh9F8VPK8 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pcdh9F8VPK8 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pcdh9F8VPK8 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pcdh9F8VPK8 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Pcdh9F8VPK8 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pcdh9F8VPK8 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pcdh9F8VPK8 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pcdh9F8VPK8 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pcdh9F8VPK8 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pcdh9F8VPK8 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pcdh9F8VPK8 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pcdh9F8VPK8 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pcdh9F8VPK8 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Pcdh9F8VPK8 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Pcdh9F8VPK8 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Pcdh9F8VPK8 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Pcdh9F8VPK8 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Pcdh9F8VPK8 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
Pcdh9F8VPK8 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Pcdh9F8VPK8 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Pcdh9F8VPK8 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.1 ms