Protein–RNA interactions for Protein: F7BCN9

Gm28038, Predicted gene, 28038 (Fragment), mousemouse

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Length 126 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28038F7BCN9 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm28038F7BCN9 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm28038F7BCN9 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm28038F7BCN9 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm28038F7BCN9 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm28038F7BCN9 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm28038F7BCN9 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm28038F7BCN9 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm28038F7BCN9 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm28038F7BCN9 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm28038F7BCN9 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm28038F7BCN9 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm28038F7BCN9 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm28038F7BCN9 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm28038F7BCN9 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm28038F7BCN9 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm28038F7BCN9 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm28038F7BCN9 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm28038F7BCN9 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm28038F7BCN9 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm28038F7BCN9 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm28038F7BCN9 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm28038F7BCN9 Gm15567-201ENSMUST00000148699 2130 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm28038F7BCN9 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm28038F7BCN9 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm28038F7BCN9 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm28038F7BCN9 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm28038F7BCN9 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm28038F7BCN9 4921524J17Rik-201ENSMUST00000047749 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm28038F7BCN9 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.63
Gm28038F7BCN9 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Gm28038F7BCN9 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Gm28038F7BCN9 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Gm28038F7BCN9 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Gm28038F7BCN9 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Gm28038F7BCN9 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Gm28038F7BCN9 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Gm28038F7BCN9 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Gm28038F7BCN9 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Gm28038F7BCN9 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Gm28038F7BCN9 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm28038F7BCN9 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm28038F7BCN9 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm28038F7BCN9 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm28038F7BCN9 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm28038F7BCN9 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm28038F7BCN9 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm28038F7BCN9 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm28038F7BCN9 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm28038F7BCN9 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm28038F7BCN9 4930412E21Rik-201ENSMUST00000194267 778 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
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Gm28038F7BCN9 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm28038F7BCN9 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm28038F7BCN9 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm28038F7BCN9 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm28038F7BCN9 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm28038F7BCN9 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm28038F7BCN9 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm28038F7BCN9 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm28038F7BCN9 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm28038F7BCN9 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm28038F7BCN9 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm28038F7BCN9 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm28038F7BCN9 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm28038F7BCN9 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
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Gm28038F7BCN9 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm28038F7BCN9 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm28038F7BCN9 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm28038F7BCN9 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm28038F7BCN9 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm28038F7BCN9 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm28038F7BCN9 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm28038F7BCN9 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm28038F7BCN9 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm28038F7BCN9 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm28038F7BCN9 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm28038F7BCN9 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm28038F7BCN9 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm28038F7BCN9 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm28038F7BCN9 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm28038F7BCN9 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm28038F7BCN9 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm28038F7BCN9 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm28038F7BCN9 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm28038F7BCN9 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm28038F7BCN9 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm28038F7BCN9 Gm23958-201ENSMUST00000157207 105 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm28038F7BCN9 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm28038F7BCN9 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm28038F7BCN9 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm28038F7BCN9 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm28038F7BCN9 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm28038F7BCN9 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm28038F7BCN9 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm28038F7BCN9 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm28038F7BCN9 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
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