Protein–RNA interactions for Protein: F7BCN0

Gm28048, Predicted gene, 28048 (Fragment), mousemouse

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Length 99 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28048F7BCN0 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm28048F7BCN0 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm28048F7BCN0 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm28048F7BCN0 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm28048F7BCN0 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm28048F7BCN0 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm28048F7BCN0 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm28048F7BCN0 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm28048F7BCN0 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm28048F7BCN0 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm28048F7BCN0 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm28048F7BCN0 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm28048F7BCN0 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm28048F7BCN0 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm28048F7BCN0 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm28048F7BCN0 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm28048F7BCN0 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm28048F7BCN0 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm28048F7BCN0 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm28048F7BCN0 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm28048F7BCN0 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm28048F7BCN0 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm28048F7BCN0 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm28048F7BCN0 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC13.86□□□□□ -0.19
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Gm28048F7BCN0 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm28048F7BCN0 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm28048F7BCN0 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm28048F7BCN0 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm28048F7BCN0 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm28048F7BCN0 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
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Gm28048F7BCN0 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm28048F7BCN0 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm28048F7BCN0 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm28048F7BCN0 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm28048F7BCN0 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm28048F7BCN0 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm28048F7BCN0 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm28048F7BCN0 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm28048F7BCN0 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm28048F7BCN0 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm28048F7BCN0 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm28048F7BCN0 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm28048F7BCN0 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm28048F7BCN0 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm28048F7BCN0 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm28048F7BCN0 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm28048F7BCN0 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm28048F7BCN0 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm28048F7BCN0 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm28048F7BCN0 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm28048F7BCN0 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm28048F7BCN0 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
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Gm28048F7BCN0 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm28048F7BCN0 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm28048F7BCN0 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm28048F7BCN0 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm28048F7BCN0 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm28048F7BCN0 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
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Gm28048F7BCN0 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
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Gm28048F7BCN0 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm28048F7BCN0 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm28048F7BCN0 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
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Gm28048F7BCN0 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm28048F7BCN0 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm28048F7BCN0 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm28048F7BCN0 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm28048F7BCN0 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm28048F7BCN0 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm28048F7BCN0 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm28048F7BCN0 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gm28048F7BCN0 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gm28048F7BCN0 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gm28048F7BCN0 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gm28048F7BCN0 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gm28048F7BCN0 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gm28048F7BCN0 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gm28048F7BCN0 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gm28048F7BCN0 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gm28048F7BCN0 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gm28048F7BCN0 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gm28048F7BCN0 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Gm28048F7BCN0 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gm28048F7BCN0 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gm28048F7BCN0 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Gm28048F7BCN0 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gm28048F7BCN0 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
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