Protein–RNA interactions for Protein: F6V0H0

Pagr1b, PAXIP1-associated glutamate-rich protein 1B (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 108 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pagr1bF6V0H0 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pagr1bF6V0H0 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pagr1bF6V0H0 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pagr1bF6V0H0 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pagr1bF6V0H0 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pagr1bF6V0H0 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pagr1bF6V0H0 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pagr1bF6V0H0 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pagr1bF6V0H0 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pagr1bF6V0H0 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pagr1bF6V0H0 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pagr1bF6V0H0 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pagr1bF6V0H0 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pagr1bF6V0H0 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pagr1bF6V0H0 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pagr1bF6V0H0 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pagr1bF6V0H0 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pagr1bF6V0H0 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Pagr1bF6V0H0 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pagr1bF6V0H0 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pagr1bF6V0H0 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pagr1bF6V0H0 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pagr1bF6V0H0 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Pagr1bF6V0H0 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pagr1bF6V0H0 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pagr1bF6V0H0 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pagr1bF6V0H0 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pagr1bF6V0H0 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Pagr1bF6V0H0 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Pagr1bF6V0H0 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pagr1bF6V0H0 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pagr1bF6V0H0 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pagr1bF6V0H0 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pagr1bF6V0H0 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pagr1bF6V0H0 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pagr1bF6V0H0 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pagr1bF6V0H0 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pagr1bF6V0H0 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pagr1bF6V0H0 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pagr1bF6V0H0 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pagr1bF6V0H0 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pagr1bF6V0H0 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pagr1bF6V0H0 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pagr1bF6V0H0 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pagr1bF6V0H0 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Pagr1bF6V0H0 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pagr1bF6V0H0 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pagr1bF6V0H0 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Pagr1bF6V0H0 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pagr1bF6V0H0 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pagr1bF6V0H0 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Pagr1bF6V0H0 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Pagr1bF6V0H0 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pagr1bF6V0H0 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pagr1bF6V0H0 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pagr1bF6V0H0 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pagr1bF6V0H0 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pagr1bF6V0H0 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pagr1bF6V0H0 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pagr1bF6V0H0 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pagr1bF6V0H0 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pagr1bF6V0H0 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pagr1bF6V0H0 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pagr1bF6V0H0 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pagr1bF6V0H0 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pagr1bF6V0H0 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pagr1bF6V0H0 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Pagr1bF6V0H0 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pagr1bF6V0H0 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pagr1bF6V0H0 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pagr1bF6V0H0 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pagr1bF6V0H0 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pagr1bF6V0H0 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pagr1bF6V0H0 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pagr1bF6V0H0 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pagr1bF6V0H0 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pagr1bF6V0H0 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pagr1bF6V0H0 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pagr1bF6V0H0 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pagr1bF6V0H0 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pagr1bF6V0H0 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pagr1bF6V0H0 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pagr1bF6V0H0 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pagr1bF6V0H0 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pagr1bF6V0H0 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pagr1bF6V0H0 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pagr1bF6V0H0 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Pagr1bF6V0H0 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pagr1bF6V0H0 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pagr1bF6V0H0 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pagr1bF6V0H0 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pagr1bF6V0H0 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pagr1bF6V0H0 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pagr1bF6V0H0 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pagr1bF6V0H0 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pagr1bF6V0H0 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pagr1bF6V0H0 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pagr1bF6V0H0 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pagr1bF6V0H0 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pagr1bF6V0H0 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms