Protein–RNA interactions for Protein: F6QRE9

Erich3, Glutamate-rich 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,637 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Erich3F6QRE9 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Erich3F6QRE9 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Erich3F6QRE9 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Erich3F6QRE9 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Erich3F6QRE9 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Erich3F6QRE9 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Erich3F6QRE9 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Erich3F6QRE9 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Erich3F6QRE9 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Erich3F6QRE9 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Erich3F6QRE9 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Erich3F6QRE9 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Erich3F6QRE9 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Erich3F6QRE9 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Erich3F6QRE9 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Erich3F6QRE9 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Erich3F6QRE9 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Erich3F6QRE9 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Erich3F6QRE9 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Erich3F6QRE9 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Erich3F6QRE9 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Erich3F6QRE9 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Erich3F6QRE9 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Erich3F6QRE9 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Erich3F6QRE9 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Erich3F6QRE9 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Erich3F6QRE9 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Erich3F6QRE9 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Erich3F6QRE9 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Erich3F6QRE9 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Erich3F6QRE9 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Erich3F6QRE9 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Erich3F6QRE9 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Erich3F6QRE9 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Erich3F6QRE9 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Erich3F6QRE9 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Erich3F6QRE9 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Erich3F6QRE9 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Erich3F6QRE9 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Erich3F6QRE9 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Erich3F6QRE9 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Erich3F6QRE9 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Erich3F6QRE9 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Erich3F6QRE9 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Erich3F6QRE9 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Erich3F6QRE9 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Erich3F6QRE9 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Erich3F6QRE9 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Erich3F6QRE9 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Erich3F6QRE9 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Erich3F6QRE9 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Erich3F6QRE9 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Erich3F6QRE9 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Erich3F6QRE9 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Erich3F6QRE9 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Erich3F6QRE9 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Erich3F6QRE9 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Erich3F6QRE9 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Erich3F6QRE9 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Erich3F6QRE9 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Erich3F6QRE9 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Erich3F6QRE9 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Erich3F6QRE9 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Erich3F6QRE9 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Erich3F6QRE9 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Erich3F6QRE9 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Erich3F6QRE9 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Erich3F6QRE9 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Erich3F6QRE9 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Erich3F6QRE9 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Erich3F6QRE9 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Erich3F6QRE9 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Erich3F6QRE9 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Erich3F6QRE9 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Erich3F6QRE9 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Erich3F6QRE9 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Erich3F6QRE9 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Erich3F6QRE9 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Erich3F6QRE9 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Erich3F6QRE9 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Erich3F6QRE9 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Erich3F6QRE9 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Erich3F6QRE9 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Erich3F6QRE9 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Erich3F6QRE9 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Erich3F6QRE9 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Erich3F6QRE9 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Erich3F6QRE9 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Erich3F6QRE9 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Erich3F6QRE9 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Erich3F6QRE9 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Erich3F6QRE9 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Erich3F6QRE9 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Erich3F6QRE9 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Erich3F6QRE9 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Erich3F6QRE9 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Erich3F6QRE9 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Erich3F6QRE9 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Erich3F6QRE9 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Erich3F6QRE9 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms