Protein–RNA interactions for Protein: E9QA62

Lmod3, Leiomodin-3, mousemouse

Predictions only

Length 571 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmod3E9QA62 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Lmod3E9QA62 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Lmod3E9QA62 Zfp142-203ENSMUST00000113737 7473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Lmod3E9QA62 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Lmod3E9QA62 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Lmod3E9QA62 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Lmod3E9QA62 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Lmod3E9QA62 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Lmod3E9QA62 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Lmod3E9QA62 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Lmod3E9QA62 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Lmod3E9QA62 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Lmod3E9QA62 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Lmod3E9QA62 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Lmod3E9QA62 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Lmod3E9QA62 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Lmod3E9QA62 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Lmod3E9QA62 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Lmod3E9QA62 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Lmod3E9QA62 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Lmod3E9QA62 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Lmod3E9QA62 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Lmod3E9QA62 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Lmod3E9QA62 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Lmod3E9QA62 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Lmod3E9QA62 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Lmod3E9QA62 Nrxn1-202ENSMUST00000072671 8118 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Lmod3E9QA62 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Lmod3E9QA62 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Lmod3E9QA62 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Lmod3E9QA62 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Lmod3E9QA62 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Lmod3E9QA62 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Lmod3E9QA62 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Lmod3E9QA62 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Lmod3E9QA62 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Lmod3E9QA62 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Lmod3E9QA62 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Lmod3E9QA62 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Lmod3E9QA62 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Lmod3E9QA62 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Lmod3E9QA62 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Lmod3E9QA62 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Lmod3E9QA62 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Lmod3E9QA62 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Lmod3E9QA62 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Lmod3E9QA62 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Lmod3E9QA62 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Lmod3E9QA62 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Lmod3E9QA62 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Lmod3E9QA62 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Lmod3E9QA62 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Lmod3E9QA62 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Lmod3E9QA62 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Lmod3E9QA62 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Lmod3E9QA62 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Lmod3E9QA62 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Lmod3E9QA62 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Lmod3E9QA62 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Lmod3E9QA62 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Lmod3E9QA62 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Lmod3E9QA62 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Lmod3E9QA62 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Lmod3E9QA62 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Lmod3E9QA62 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Lmod3E9QA62 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Lmod3E9QA62 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Lmod3E9QA62 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Lmod3E9QA62 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Lmod3E9QA62 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Lmod3E9QA62 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Lmod3E9QA62 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Lmod3E9QA62 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Lmod3E9QA62 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Lmod3E9QA62 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Lmod3E9QA62 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Lmod3E9QA62 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Lmod3E9QA62 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Lmod3E9QA62 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Lmod3E9QA62 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Lmod3E9QA62 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Lmod3E9QA62 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Lmod3E9QA62 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Lmod3E9QA62 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Lmod3E9QA62 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Lmod3E9QA62 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Lmod3E9QA62 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Lmod3E9QA62 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Lmod3E9QA62 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Lmod3E9QA62 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Lmod3E9QA62 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Lmod3E9QA62 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Lmod3E9QA62 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Lmod3E9QA62 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Lmod3E9QA62 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Lmod3E9QA62 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Lmod3E9QA62 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Lmod3E9QA62 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Lmod3E9QA62 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Lmod3E9QA62 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37 ms