Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9F7

Ccdc146, Coiled-coil domain-containing 146, mousemouse

Predictions only

Length 977 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc146E9Q9F7 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc146E9Q9F7 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc146E9Q9F7 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc146E9Q9F7 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc146E9Q9F7 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc146E9Q9F7 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc146E9Q9F7 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc146E9Q9F7 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc146E9Q9F7 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc146E9Q9F7 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc146E9Q9F7 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc146E9Q9F7 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc146E9Q9F7 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc146E9Q9F7 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc146E9Q9F7 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc146E9Q9F7 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc146E9Q9F7 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc146E9Q9F7 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc146E9Q9F7 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc146E9Q9F7 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc146E9Q9F7 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc146E9Q9F7 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc146E9Q9F7 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc146E9Q9F7 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc146E9Q9F7 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc146E9Q9F7 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc146E9Q9F7 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc146E9Q9F7 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc146E9Q9F7 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc146E9Q9F7 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc146E9Q9F7 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc146E9Q9F7 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc146E9Q9F7 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc146E9Q9F7 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc146E9Q9F7 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc146E9Q9F7 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc146E9Q9F7 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc146E9Q9F7 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc146E9Q9F7 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc146E9Q9F7 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc146E9Q9F7 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc146E9Q9F7 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc146E9Q9F7 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc146E9Q9F7 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc146E9Q9F7 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc146E9Q9F7 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc146E9Q9F7 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc146E9Q9F7 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc146E9Q9F7 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc146E9Q9F7 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc146E9Q9F7 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc146E9Q9F7 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc146E9Q9F7 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc146E9Q9F7 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc146E9Q9F7 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc146E9Q9F7 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc146E9Q9F7 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc146E9Q9F7 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc146E9Q9F7 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc146E9Q9F7 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc146E9Q9F7 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc146E9Q9F7 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc146E9Q9F7 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc146E9Q9F7 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc146E9Q9F7 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc146E9Q9F7 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc146E9Q9F7 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc146E9Q9F7 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc146E9Q9F7 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc146E9Q9F7 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc146E9Q9F7 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc146E9Q9F7 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc146E9Q9F7 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc146E9Q9F7 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc146E9Q9F7 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc146E9Q9F7 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc146E9Q9F7 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc146E9Q9F7 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc146E9Q9F7 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc146E9Q9F7 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Ccdc146E9Q9F7 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc146E9Q9F7 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc146E9Q9F7 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc146E9Q9F7 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc146E9Q9F7 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc146E9Q9F7 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc146E9Q9F7 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc146E9Q9F7 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc146E9Q9F7 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc146E9Q9F7 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc146E9Q9F7 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc146E9Q9F7 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc146E9Q9F7 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc146E9Q9F7 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc146E9Q9F7 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc146E9Q9F7 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc146E9Q9F7 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc146E9Q9F7 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc146E9Q9F7 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc146E9Q9F7 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.4 ms