Protein–RNA interactions for Protein: E9Q6B2

Ccdc85c, Coiled-coil domain-containing protein 85C, mousemouse

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc85cE9Q6B2 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc85cE9Q6B2 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc85cE9Q6B2 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc85cE9Q6B2 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc85cE9Q6B2 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc85cE9Q6B2 Gm12199-201ENSMUST00000137567 517 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc85cE9Q6B2 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc85cE9Q6B2 Gm16570-201ENSMUST00000161951 436 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc85cE9Q6B2 Rn7s1-201ENSMUST00000174924 300 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc85cE9Q6B2 Rn7s2-201ENSMUST00000175032 300 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc85cE9Q6B2 Gm26461-201ENSMUST00000175064 290 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc85cE9Q6B2 Rad51d-202ENSMUST00000021033 1201 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc85cE9Q6B2 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc85cE9Q6B2 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc85cE9Q6B2 Olfr707-201ENSMUST00000088687 924 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc85cE9Q6B2 Olfr1532-ps1-201ENSMUST00000098140 924 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc85cE9Q6B2 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc85cE9Q6B2 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc85cE9Q6B2 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc85cE9Q6B2 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc85cE9Q6B2 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc85cE9Q6B2 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc85cE9Q6B2 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc85cE9Q6B2 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc85cE9Q6B2 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc85cE9Q6B2 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc85cE9Q6B2 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc85cE9Q6B2 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc85cE9Q6B2 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc85cE9Q6B2 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc85cE9Q6B2 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc85cE9Q6B2 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc85cE9Q6B2 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc85cE9Q6B2 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc85cE9Q6B2 Ccdc190-201ENSMUST00000094348 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc85cE9Q6B2 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc85cE9Q6B2 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc85cE9Q6B2 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc85cE9Q6B2 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc85cE9Q6B2 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc85cE9Q6B2 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc85cE9Q6B2 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc85cE9Q6B2 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc85cE9Q6B2 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc85cE9Q6B2 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc85cE9Q6B2 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc85cE9Q6B2 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc85cE9Q6B2 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc85cE9Q6B2 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc85cE9Q6B2 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc85cE9Q6B2 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc85cE9Q6B2 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc85cE9Q6B2 Rhox2g-201ENSMUST00000115169 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc85cE9Q6B2 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc85cE9Q6B2 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc85cE9Q6B2 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc85cE9Q6B2 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc85cE9Q6B2 Polr2e-201ENSMUST00000004786 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc85cE9Q6B2 Txn2-201ENSMUST00000005487 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc85cE9Q6B2 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc85cE9Q6B2 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc85cE9Q6B2 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc85cE9Q6B2 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc85cE9Q6B2 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc85cE9Q6B2 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc85cE9Q6B2 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc85cE9Q6B2 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc85cE9Q6B2 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc85cE9Q6B2 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc85cE9Q6B2 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc85cE9Q6B2 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc85cE9Q6B2 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc85cE9Q6B2 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc85cE9Q6B2 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc85cE9Q6B2 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc85cE9Q6B2 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc85cE9Q6B2 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc85cE9Q6B2 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc85cE9Q6B2 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc85cE9Q6B2 Gm15236-201ENSMUST00000117309 379 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc85cE9Q6B2 Gm15635-202ENSMUST00000131160 917 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc85cE9Q6B2 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc85cE9Q6B2 1110006O24Rik-201ENSMUST00000201728 768 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc85cE9Q6B2 Svip-203ENSMUST00000209193 487 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc85cE9Q6B2 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc85cE9Q6B2 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc85cE9Q6B2 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc85cE9Q6B2 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc85cE9Q6B2 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc85cE9Q6B2 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc85cE9Q6B2 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc85cE9Q6B2 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc85cE9Q6B2 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc85cE9Q6B2 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc85cE9Q6B2 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc85cE9Q6B2 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc85cE9Q6B2 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc85cE9Q6B2 Swi5-207ENSMUST00000183946 768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc85cE9Q6B2 Sox2ot-208ENSMUST00000197103 802 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc85cE9Q6B2 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.3 ms