Protein–RNA interactions for Protein: E9Q548

Gm20518, Predicted gene 20518, mousemouse

Predictions only

Length 580 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20518E9Q548 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm20518E9Q548 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm20518E9Q548 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm20518E9Q548 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm20518E9Q548 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm20518E9Q548 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm20518E9Q548 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm20518E9Q548 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm20518E9Q548 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm20518E9Q548 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm20518E9Q548 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm20518E9Q548 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm20518E9Q548 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm20518E9Q548 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm20518E9Q548 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm20518E9Q548 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm20518E9Q548 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm20518E9Q548 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm20518E9Q548 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm20518E9Q548 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm20518E9Q548 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm20518E9Q548 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm20518E9Q548 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm20518E9Q548 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm20518E9Q548 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm20518E9Q548 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm20518E9Q548 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm20518E9Q548 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm20518E9Q548 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm20518E9Q548 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm20518E9Q548 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm20518E9Q548 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm20518E9Q548 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm20518E9Q548 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm20518E9Q548 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm20518E9Q548 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm20518E9Q548 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm20518E9Q548 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm20518E9Q548 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm20518E9Q548 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm20518E9Q548 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm20518E9Q548 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm20518E9Q548 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm20518E9Q548 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm20518E9Q548 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm20518E9Q548 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm20518E9Q548 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm20518E9Q548 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm20518E9Q548 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm20518E9Q548 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm20518E9Q548 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm20518E9Q548 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm20518E9Q548 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm20518E9Q548 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm20518E9Q548 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm20518E9Q548 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm20518E9Q548 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm20518E9Q548 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm20518E9Q548 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm20518E9Q548 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm20518E9Q548 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm20518E9Q548 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm20518E9Q548 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm20518E9Q548 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm20518E9Q548 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
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Gm20518E9Q548 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm20518E9Q548 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm20518E9Q548 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm20518E9Q548 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm20518E9Q548 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm20518E9Q548 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm20518E9Q548 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm20518E9Q548 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm20518E9Q548 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm20518E9Q548 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm20518E9Q548 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm20518E9Q548 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm20518E9Q548 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm20518E9Q548 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm20518E9Q548 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm20518E9Q548 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm20518E9Q548 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm20518E9Q548 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm20518E9Q548 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm20518E9Q548 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm20518E9Q548 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm20518E9Q548 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm20518E9Q548 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm20518E9Q548 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm20518E9Q548 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm20518E9Q548 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm20518E9Q548 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm20518E9Q548 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm20518E9Q548 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm20518E9Q548 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm20518E9Q548 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm20518E9Q548 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm20518E9Q548 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm20518E9Q548 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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