Protein–RNA interactions for Protein: E9Q414

Apob, Apolipoprotein B-100, mousemouse

Predictions only

Length 4,505 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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ApobE9Q414 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
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ApobE9Q414 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
ApobE9Q414 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC8.99□□□□□ -0.97
ApobE9Q414 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
ApobE9Q414 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
ApobE9Q414 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
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ApobE9Q414 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
ApobE9Q414 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
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ApobE9Q414 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
ApobE9Q414 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
ApobE9Q414 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
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ApobE9Q414 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
ApobE9Q414 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
ApobE9Q414 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
ApobE9Q414 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
ApobE9Q414 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
ApobE9Q414 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
ApobE9Q414 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC8.97□□□□□ -0.97
ApobE9Q414 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC8.97□□□□□ -0.97
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ApobE9Q414 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
ApobE9Q414 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
ApobE9Q414 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC8.97□□□□□ -0.97
ApobE9Q414 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.96□□□□□ -0.97
ApobE9Q414 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.97
ApobE9Q414 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.97
ApobE9Q414 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.97
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