Protein–RNA interactions for Protein: E9Q2T4

4930523C07Rik, RIKEN cDNA 4930523C07 gene, mousemouse

Predictions only

Length 99 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930523C07RikE9Q2T4 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
4930523C07RikE9Q2T4 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
4930523C07RikE9Q2T4 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
4930523C07RikE9Q2T4 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
4930523C07RikE9Q2T4 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
4930523C07RikE9Q2T4 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
4930523C07RikE9Q2T4 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
4930523C07RikE9Q2T4 Tmem254b-202ENSMUST00000100806 1108 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
4930523C07RikE9Q2T4 Tmem254a-201ENSMUST00000100811 1108 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
4930523C07RikE9Q2T4 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
4930523C07RikE9Q2T4 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
4930523C07RikE9Q2T4 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
4930523C07RikE9Q2T4 Fxyd1-217ENSMUST00000206860 594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
4930523C07RikE9Q2T4 Gm39318-201ENSMUST00000214606 1118 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
4930523C07RikE9Q2T4 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
4930523C07RikE9Q2T4 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
4930523C07RikE9Q2T4 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
4930523C07RikE9Q2T4 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
4930523C07RikE9Q2T4 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
4930523C07RikE9Q2T4 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
4930523C07RikE9Q2T4 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
4930523C07RikE9Q2T4 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
4930523C07RikE9Q2T4 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
4930523C07RikE9Q2T4 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
4930523C07RikE9Q2T4 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
4930523C07RikE9Q2T4 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
4930523C07RikE9Q2T4 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
4930523C07RikE9Q2T4 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
4930523C07RikE9Q2T4 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
4930523C07RikE9Q2T4 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
4930523C07RikE9Q2T4 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
4930523C07RikE9Q2T4 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
4930523C07RikE9Q2T4 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
4930523C07RikE9Q2T4 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
4930523C07RikE9Q2T4 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
4930523C07RikE9Q2T4 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
4930523C07RikE9Q2T4 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
4930523C07RikE9Q2T4 AC126253.1-201ENSMUST00000227974 824 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
4930523C07RikE9Q2T4 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
4930523C07RikE9Q2T4 Polr2e-201ENSMUST00000004786 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
4930523C07RikE9Q2T4 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
4930523C07RikE9Q2T4 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
4930523C07RikE9Q2T4 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
4930523C07RikE9Q2T4 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
4930523C07RikE9Q2T4 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
4930523C07RikE9Q2T4 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
4930523C07RikE9Q2T4 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
4930523C07RikE9Q2T4 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
4930523C07RikE9Q2T4 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
4930523C07RikE9Q2T4 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
4930523C07RikE9Q2T4 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
4930523C07RikE9Q2T4 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
4930523C07RikE9Q2T4 Gm27572-201ENSMUST00000183702 255 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
4930523C07RikE9Q2T4 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
4930523C07RikE9Q2T4 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
4930523C07RikE9Q2T4 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
4930523C07RikE9Q2T4 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
4930523C07RikE9Q2T4 Gm29154-230ENSMUST00000215044 1165 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
4930523C07RikE9Q2T4 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
4930523C07RikE9Q2T4 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
4930523C07RikE9Q2T4 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
4930523C07RikE9Q2T4 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
4930523C07RikE9Q2T4 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
4930523C07RikE9Q2T4 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
4930523C07RikE9Q2T4 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
4930523C07RikE9Q2T4 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
4930523C07RikE9Q2T4 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
4930523C07RikE9Q2T4 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
4930523C07RikE9Q2T4 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
4930523C07RikE9Q2T4 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
4930523C07RikE9Q2T4 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
4930523C07RikE9Q2T4 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
4930523C07RikE9Q2T4 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
4930523C07RikE9Q2T4 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
4930523C07RikE9Q2T4 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
4930523C07RikE9Q2T4 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
4930523C07RikE9Q2T4 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
4930523C07RikE9Q2T4 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
4930523C07RikE9Q2T4 Gm38241-201ENSMUST00000192641 898 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
4930523C07RikE9Q2T4 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
4930523C07RikE9Q2T4 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
4930523C07RikE9Q2T4 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
4930523C07RikE9Q2T4 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
4930523C07RikE9Q2T4 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
4930523C07RikE9Q2T4 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
4930523C07RikE9Q2T4 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
4930523C07RikE9Q2T4 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
4930523C07RikE9Q2T4 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
4930523C07RikE9Q2T4 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
4930523C07RikE9Q2T4 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
4930523C07RikE9Q2T4 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
4930523C07RikE9Q2T4 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
4930523C07RikE9Q2T4 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
4930523C07RikE9Q2T4 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
4930523C07RikE9Q2T4 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
4930523C07RikE9Q2T4 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
4930523C07RikE9Q2T4 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
4930523C07RikE9Q2T4 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
4930523C07RikE9Q2T4 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
4930523C07RikE9Q2T4 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.5 ms