Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1M1

Pdzd2, PDZ domain-containing 2, mousemouse

Predictions only

Length 2,796 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzd2E9Q1M1 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Pdzd2E9Q1M1 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Pdzd2E9Q1M1 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Pdzd2E9Q1M1 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Pdzd2E9Q1M1 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Pdzd2E9Q1M1 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Pdzd2E9Q1M1 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Pdzd2E9Q1M1 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Pdzd2E9Q1M1 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Pdzd2E9Q1M1 Gm28511-201ENSMUST00000191594 450 ntTSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Pdzd2E9Q1M1 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Pdzd2E9Q1M1 Gm7172-201ENSMUST00000218047 1152 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Pdzd2E9Q1M1 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Pdzd2E9Q1M1 CT009713.10-202ENSMUST00000225734 696 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Pdzd2E9Q1M1 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Pdzd2E9Q1M1 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Pdzd2E9Q1M1 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Pdzd2E9Q1M1 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Pdzd2E9Q1M1 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Pdzd2E9Q1M1 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Pdzd2E9Q1M1 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Pdzd2E9Q1M1 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Pdzd2E9Q1M1 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Pdzd2E9Q1M1 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Pdzd2E9Q1M1 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Pdzd2E9Q1M1 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Pdzd2E9Q1M1 Gng7-205ENSMUST00000118465 875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Pdzd2E9Q1M1 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Pdzd2E9Q1M1 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Pdzd2E9Q1M1 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Pdzd2E9Q1M1 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Pdzd2E9Q1M1 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Pdzd2E9Q1M1 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Pdzd2E9Q1M1 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Pdzd2E9Q1M1 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Pdzd2E9Q1M1 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Pdzd2E9Q1M1 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Pdzd2E9Q1M1 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Pdzd2E9Q1M1 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Pdzd2E9Q1M1 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Pdzd2E9Q1M1 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Pdzd2E9Q1M1 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Pdzd2E9Q1M1 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Pdzd2E9Q1M1 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Pdzd2E9Q1M1 Gm19710-201ENSMUST00000200257 640 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Pdzd2E9Q1M1 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Pdzd2E9Q1M1 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Pdzd2E9Q1M1 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Pdzd2E9Q1M1 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Pdzd2E9Q1M1 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Pdzd2E9Q1M1 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Pdzd2E9Q1M1 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Pdzd2E9Q1M1 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Pdzd2E9Q1M1 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Pdzd2E9Q1M1 Gm22018-201ENSMUST00000104357 131 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Pdzd2E9Q1M1 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Pdzd2E9Q1M1 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Pdzd2E9Q1M1 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Pdzd2E9Q1M1 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Pdzd2E9Q1M1 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Pdzd2E9Q1M1 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Pdzd2E9Q1M1 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Pdzd2E9Q1M1 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Pdzd2E9Q1M1 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Pdzd2E9Q1M1 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Pdzd2E9Q1M1 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Pdzd2E9Q1M1 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Pdzd2E9Q1M1 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Pdzd2E9Q1M1 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
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Pdzd2E9Q1M1 1700120C18Rik-201ENSMUST00000182952 985 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Pdzd2E9Q1M1 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Pdzd2E9Q1M1 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Pdzd2E9Q1M1 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Pdzd2E9Q1M1 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Pdzd2E9Q1M1 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Pdzd2E9Q1M1 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Pdzd2E9Q1M1 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Pdzd2E9Q1M1 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Pdzd2E9Q1M1 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Pdzd2E9Q1M1 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Pdzd2E9Q1M1 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Pdzd2E9Q1M1 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Pdzd2E9Q1M1 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Pdzd2E9Q1M1 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Pdzd2E9Q1M1 AC159896.2-201ENSMUST00000214753 269 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Pdzd2E9Q1M1 AC154319.1-201ENSMUST00000216330 312 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Pdzd2E9Q1M1 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Pdzd2E9Q1M1 AL589735.1-201ENSMUST00000224353 270 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Pdzd2E9Q1M1 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Pdzd2E9Q1M1 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Pdzd2E9Q1M1 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Pdzd2E9Q1M1 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Pdzd2E9Q1M1 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Pdzd2E9Q1M1 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Pdzd2E9Q1M1 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Pdzd2E9Q1M1 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Pdzd2E9Q1M1 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Pdzd2E9Q1M1 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
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