Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1F5

Myo5c, Myosin VC, mousemouse

Predictions only

Length 1,742 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myo5cE9Q1F5 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Myo5cE9Q1F5 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Myo5cE9Q1F5 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Myo5cE9Q1F5 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Myo5cE9Q1F5 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Myo5cE9Q1F5 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Myo5cE9Q1F5 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Myo5cE9Q1F5 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Myo5cE9Q1F5 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Myo5cE9Q1F5 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Myo5cE9Q1F5 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Myo5cE9Q1F5 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Myo5cE9Q1F5 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Myo5cE9Q1F5 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Myo5cE9Q1F5 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Myo5cE9Q1F5 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Myo5cE9Q1F5 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Myo5cE9Q1F5 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Myo5cE9Q1F5 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Myo5cE9Q1F5 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Myo5cE9Q1F5 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Myo5cE9Q1F5 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Myo5cE9Q1F5 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Myo5cE9Q1F5 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Myo5cE9Q1F5 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Myo5cE9Q1F5 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Myo5cE9Q1F5 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Myo5cE9Q1F5 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Myo5cE9Q1F5 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Myo5cE9Q1F5 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Myo5cE9Q1F5 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Myo5cE9Q1F5 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Myo5cE9Q1F5 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Myo5cE9Q1F5 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Myo5cE9Q1F5 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Myo5cE9Q1F5 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Myo5cE9Q1F5 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Myo5cE9Q1F5 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Myo5cE9Q1F5 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Myo5cE9Q1F5 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Myo5cE9Q1F5 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Myo5cE9Q1F5 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Myo5cE9Q1F5 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Myo5cE9Q1F5 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Myo5cE9Q1F5 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Myo5cE9Q1F5 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Myo5cE9Q1F5 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Myo5cE9Q1F5 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Myo5cE9Q1F5 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Myo5cE9Q1F5 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Myo5cE9Q1F5 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Myo5cE9Q1F5 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Myo5cE9Q1F5 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Myo5cE9Q1F5 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Myo5cE9Q1F5 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Myo5cE9Q1F5 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Myo5cE9Q1F5 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Myo5cE9Q1F5 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Myo5cE9Q1F5 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Myo5cE9Q1F5 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Myo5cE9Q1F5 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Myo5cE9Q1F5 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Myo5cE9Q1F5 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Myo5cE9Q1F5 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Myo5cE9Q1F5 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Myo5cE9Q1F5 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Myo5cE9Q1F5 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Myo5cE9Q1F5 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Myo5cE9Q1F5 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
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Myo5cE9Q1F5 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Myo5cE9Q1F5 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Myo5cE9Q1F5 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Myo5cE9Q1F5 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Myo5cE9Q1F5 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Myo5cE9Q1F5 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Myo5cE9Q1F5 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Myo5cE9Q1F5 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Myo5cE9Q1F5 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Myo5cE9Q1F5 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Myo5cE9Q1F5 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Myo5cE9Q1F5 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Myo5cE9Q1F5 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Myo5cE9Q1F5 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Myo5cE9Q1F5 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Myo5cE9Q1F5 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Myo5cE9Q1F5 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Myo5cE9Q1F5 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Myo5cE9Q1F5 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Myo5cE9Q1F5 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
Myo5cE9Q1F5 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Myo5cE9Q1F5 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Myo5cE9Q1F5 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Myo5cE9Q1F5 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Myo5cE9Q1F5 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Myo5cE9Q1F5 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Myo5cE9Q1F5 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Myo5cE9Q1F5 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Myo5cE9Q1F5 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
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