Protein–RNA interactions for Protein: E9PZQ1

Ddx60, DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) box polypeptide 60, mousemouse

Predictions only

Length 1,711 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx60E9PZQ1 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ddx60E9PZQ1 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ddx60E9PZQ1 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ddx60E9PZQ1 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ddx60E9PZQ1 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Ddx60E9PZQ1 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ddx60E9PZQ1 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ddx60E9PZQ1 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ddx60E9PZQ1 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ddx60E9PZQ1 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ddx60E9PZQ1 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ddx60E9PZQ1 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ddx60E9PZQ1 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ddx60E9PZQ1 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ddx60E9PZQ1 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ddx60E9PZQ1 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ddx60E9PZQ1 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ddx60E9PZQ1 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Ddx60E9PZQ1 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Ddx60E9PZQ1 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Ddx60E9PZQ1 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ddx60E9PZQ1 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ddx60E9PZQ1 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ddx60E9PZQ1 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ddx60E9PZQ1 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ddx60E9PZQ1 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ddx60E9PZQ1 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ddx60E9PZQ1 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ddx60E9PZQ1 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ddx60E9PZQ1 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ddx60E9PZQ1 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ddx60E9PZQ1 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ddx60E9PZQ1 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ddx60E9PZQ1 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ddx60E9PZQ1 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ddx60E9PZQ1 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ddx60E9PZQ1 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Ddx60E9PZQ1 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ddx60E9PZQ1 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ddx60E9PZQ1 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Ddx60E9PZQ1 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ddx60E9PZQ1 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ddx60E9PZQ1 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ddx60E9PZQ1 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ddx60E9PZQ1 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ddx60E9PZQ1 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ddx60E9PZQ1 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ddx60E9PZQ1 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ddx60E9PZQ1 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ddx60E9PZQ1 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ddx60E9PZQ1 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ddx60E9PZQ1 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ddx60E9PZQ1 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ddx60E9PZQ1 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ddx60E9PZQ1 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ddx60E9PZQ1 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ddx60E9PZQ1 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ddx60E9PZQ1 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ddx60E9PZQ1 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ddx60E9PZQ1 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ddx60E9PZQ1 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
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Ddx60E9PZQ1 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
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Ddx60E9PZQ1 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ddx60E9PZQ1 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
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Ddx60E9PZQ1 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ddx60E9PZQ1 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ddx60E9PZQ1 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ddx60E9PZQ1 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ddx60E9PZQ1 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ddx60E9PZQ1 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ddx60E9PZQ1 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ddx60E9PZQ1 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ddx60E9PZQ1 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ddx60E9PZQ1 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ddx60E9PZQ1 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ddx60E9PZQ1 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ddx60E9PZQ1 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ddx60E9PZQ1 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ddx60E9PZQ1 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ddx60E9PZQ1 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ddx60E9PZQ1 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ddx60E9PZQ1 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ddx60E9PZQ1 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ddx60E9PZQ1 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Ddx60E9PZQ1 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ddx60E9PZQ1 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Ddx60E9PZQ1 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ddx60E9PZQ1 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ddx60E9PZQ1 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ddx60E9PZQ1 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Ddx60E9PZQ1 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ddx60E9PZQ1 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
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