Protein–RNA interactions for Protein: E9PYQ0

Rsph10b, Radial spoke head 10 homolog B (Chlamydomonas), mousemouse

Predictions only

Length 876 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rsph10bE9PYQ0 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rsph10bE9PYQ0 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Rsph10bE9PYQ0 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Rsph10bE9PYQ0 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Rsph10bE9PYQ0 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rsph10bE9PYQ0 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rsph10bE9PYQ0 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rsph10bE9PYQ0 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rsph10bE9PYQ0 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rsph10bE9PYQ0 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rsph10bE9PYQ0 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rsph10bE9PYQ0 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Rsph10bE9PYQ0 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Rsph10bE9PYQ0 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rsph10bE9PYQ0 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rsph10bE9PYQ0 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rsph10bE9PYQ0 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rsph10bE9PYQ0 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rsph10bE9PYQ0 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rsph10bE9PYQ0 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Rsph10bE9PYQ0 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rsph10bE9PYQ0 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rsph10bE9PYQ0 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rsph10bE9PYQ0 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rsph10bE9PYQ0 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rsph10bE9PYQ0 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rsph10bE9PYQ0 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rsph10bE9PYQ0 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rsph10bE9PYQ0 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rsph10bE9PYQ0 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Rsph10bE9PYQ0 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rsph10bE9PYQ0 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rsph10bE9PYQ0 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rsph10bE9PYQ0 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rsph10bE9PYQ0 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rsph10bE9PYQ0 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rsph10bE9PYQ0 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rsph10bE9PYQ0 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rsph10bE9PYQ0 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rsph10bE9PYQ0 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rsph10bE9PYQ0 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rsph10bE9PYQ0 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rsph10bE9PYQ0 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Rsph10bE9PYQ0 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rsph10bE9PYQ0 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rsph10bE9PYQ0 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rsph10bE9PYQ0 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rsph10bE9PYQ0 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rsph10bE9PYQ0 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rsph10bE9PYQ0 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rsph10bE9PYQ0 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rsph10bE9PYQ0 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rsph10bE9PYQ0 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rsph10bE9PYQ0 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rsph10bE9PYQ0 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rsph10bE9PYQ0 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rsph10bE9PYQ0 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rsph10bE9PYQ0 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rsph10bE9PYQ0 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rsph10bE9PYQ0 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rsph10bE9PYQ0 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rsph10bE9PYQ0 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rsph10bE9PYQ0 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rsph10bE9PYQ0 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rsph10bE9PYQ0 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rsph10bE9PYQ0 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rsph10bE9PYQ0 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rsph10bE9PYQ0 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rsph10bE9PYQ0 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rsph10bE9PYQ0 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Rsph10bE9PYQ0 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rsph10bE9PYQ0 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rsph10bE9PYQ0 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rsph10bE9PYQ0 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Rsph10bE9PYQ0 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Rsph10bE9PYQ0 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Rsph10bE9PYQ0 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rsph10bE9PYQ0 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Rsph10bE9PYQ0 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rsph10bE9PYQ0 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rsph10bE9PYQ0 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rsph10bE9PYQ0 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rsph10bE9PYQ0 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rsph10bE9PYQ0 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rsph10bE9PYQ0 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rsph10bE9PYQ0 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rsph10bE9PYQ0 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rsph10bE9PYQ0 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rsph10bE9PYQ0 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rsph10bE9PYQ0 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rsph10bE9PYQ0 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rsph10bE9PYQ0 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rsph10bE9PYQ0 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Rsph10bE9PYQ0 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rsph10bE9PYQ0 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rsph10bE9PYQ0 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Rsph10bE9PYQ0 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rsph10bE9PYQ0 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rsph10bE9PYQ0 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rsph10bE9PYQ0 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.7 ms