Protein–RNA interactions for Protein: E9PWG2

Trappc8, Trafficking protein particle complex 8, mousemouse

Predictions only

Length 1,437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc8E9PWG2 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Trappc8E9PWG2 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Trappc8E9PWG2 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Trappc8E9PWG2 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Trappc8E9PWG2 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Trappc8E9PWG2 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Trappc8E9PWG2 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Trappc8E9PWG2 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Trappc8E9PWG2 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Trappc8E9PWG2 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Trappc8E9PWG2 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Trappc8E9PWG2 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Trappc8E9PWG2 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Trappc8E9PWG2 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Trappc8E9PWG2 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Trappc8E9PWG2 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Trappc8E9PWG2 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Trappc8E9PWG2 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Trappc8E9PWG2 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Trappc8E9PWG2 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Trappc8E9PWG2 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Trappc8E9PWG2 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Trappc8E9PWG2 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Trappc8E9PWG2 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Trappc8E9PWG2 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Trappc8E9PWG2 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Trappc8E9PWG2 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Trappc8E9PWG2 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Trappc8E9PWG2 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Trappc8E9PWG2 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Trappc8E9PWG2 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Trappc8E9PWG2 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Trappc8E9PWG2 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Trappc8E9PWG2 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Trappc8E9PWG2 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Trappc8E9PWG2 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Trappc8E9PWG2 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Trappc8E9PWG2 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Trappc8E9PWG2 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Trappc8E9PWG2 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Trappc8E9PWG2 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Trappc8E9PWG2 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Trappc8E9PWG2 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Trappc8E9PWG2 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Trappc8E9PWG2 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Trappc8E9PWG2 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Trappc8E9PWG2 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Trappc8E9PWG2 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Trappc8E9PWG2 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Trappc8E9PWG2 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Trappc8E9PWG2 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Trappc8E9PWG2 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Trappc8E9PWG2 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Trappc8E9PWG2 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Trappc8E9PWG2 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Trappc8E9PWG2 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Trappc8E9PWG2 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Trappc8E9PWG2 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Trappc8E9PWG2 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Trappc8E9PWG2 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Trappc8E9PWG2 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Trappc8E9PWG2 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Trappc8E9PWG2 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Trappc8E9PWG2 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Trappc8E9PWG2 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Trappc8E9PWG2 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Trappc8E9PWG2 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Trappc8E9PWG2 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Trappc8E9PWG2 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Trappc8E9PWG2 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Trappc8E9PWG2 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Trappc8E9PWG2 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Trappc8E9PWG2 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Trappc8E9PWG2 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Trappc8E9PWG2 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Trappc8E9PWG2 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Trappc8E9PWG2 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Trappc8E9PWG2 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Trappc8E9PWG2 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Trappc8E9PWG2 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Trappc8E9PWG2 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Trappc8E9PWG2 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Trappc8E9PWG2 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Trappc8E9PWG2 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Trappc8E9PWG2 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Trappc8E9PWG2 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Trappc8E9PWG2 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Trappc8E9PWG2 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Trappc8E9PWG2 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Trappc8E9PWG2 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Trappc8E9PWG2 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Trappc8E9PWG2 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Trappc8E9PWG2 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Trappc8E9PWG2 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Trappc8E9PWG2 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Trappc8E9PWG2 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Trappc8E9PWG2 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Trappc8E9PWG2 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Trappc8E9PWG2 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Trappc8E9PWG2 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms