Protein–RNA interactions for Protein: E9PW80

Gm3298, Predicted gene 3298, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3298E9PW80 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm3298E9PW80 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm3298E9PW80 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm3298E9PW80 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm3298E9PW80 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm3298E9PW80 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm3298E9PW80 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm3298E9PW80 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm3298E9PW80 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm3298E9PW80 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm3298E9PW80 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm3298E9PW80 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm3298E9PW80 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm3298E9PW80 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm3298E9PW80 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm3298E9PW80 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm3298E9PW80 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm3298E9PW80 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm3298E9PW80 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm3298E9PW80 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm3298E9PW80 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm3298E9PW80 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm3298E9PW80 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm3298E9PW80 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm3298E9PW80 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm3298E9PW80 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm3298E9PW80 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm3298E9PW80 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm3298E9PW80 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm3298E9PW80 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm3298E9PW80 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm3298E9PW80 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm3298E9PW80 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm3298E9PW80 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm3298E9PW80 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm3298E9PW80 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm3298E9PW80 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm3298E9PW80 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm3298E9PW80 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm3298E9PW80 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm3298E9PW80 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm3298E9PW80 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm3298E9PW80 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm3298E9PW80 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm3298E9PW80 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm3298E9PW80 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm3298E9PW80 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm3298E9PW80 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm3298E9PW80 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Gm3298E9PW80 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Gm3298E9PW80 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Gm3298E9PW80 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Gm3298E9PW80 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Gm3298E9PW80 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Gm3298E9PW80 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm3298E9PW80 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm3298E9PW80 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm3298E9PW80 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm3298E9PW80 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm3298E9PW80 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm3298E9PW80 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm3298E9PW80 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm3298E9PW80 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm3298E9PW80 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm3298E9PW80 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm3298E9PW80 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm3298E9PW80 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm3298E9PW80 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm3298E9PW80 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm3298E9PW80 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm3298E9PW80 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm3298E9PW80 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm3298E9PW80 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm3298E9PW80 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm3298E9PW80 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm3298E9PW80 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm3298E9PW80 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm3298E9PW80 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm3298E9PW80 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm3298E9PW80 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm3298E9PW80 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm3298E9PW80 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm3298E9PW80 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm3298E9PW80 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm3298E9PW80 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm3298E9PW80 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm3298E9PW80 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm3298E9PW80 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm3298E9PW80 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm3298E9PW80 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm3298E9PW80 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm3298E9PW80 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm3298E9PW80 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm3298E9PW80 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm3298E9PW80 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm3298E9PW80 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm3298E9PW80 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm3298E9PW80 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm3298E9PW80 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm3298E9PW80 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86.2 ms