Protein–RNA interactions for Protein: E9PVZ3

Ccdc144b, Coiled-coil domain-containing 144B, mousemouse

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc144bE9PVZ3 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc144bE9PVZ3 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc144bE9PVZ3 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc144bE9PVZ3 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc144bE9PVZ3 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc144bE9PVZ3 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc144bE9PVZ3 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc144bE9PVZ3 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc144bE9PVZ3 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc144bE9PVZ3 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc144bE9PVZ3 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc144bE9PVZ3 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc144bE9PVZ3 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc144bE9PVZ3 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc144bE9PVZ3 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc144bE9PVZ3 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc144bE9PVZ3 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc144bE9PVZ3 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc144bE9PVZ3 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc144bE9PVZ3 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc144bE9PVZ3 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc144bE9PVZ3 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc144bE9PVZ3 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc144bE9PVZ3 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc144bE9PVZ3 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc144bE9PVZ3 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc144bE9PVZ3 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc144bE9PVZ3 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc144bE9PVZ3 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc144bE9PVZ3 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc144bE9PVZ3 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc144bE9PVZ3 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc144bE9PVZ3 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc144bE9PVZ3 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc144bE9PVZ3 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc144bE9PVZ3 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc144bE9PVZ3 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc144bE9PVZ3 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc144bE9PVZ3 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc144bE9PVZ3 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc144bE9PVZ3 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc144bE9PVZ3 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc144bE9PVZ3 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc144bE9PVZ3 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc144bE9PVZ3 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc144bE9PVZ3 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc144bE9PVZ3 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc144bE9PVZ3 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc144bE9PVZ3 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc144bE9PVZ3 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc144bE9PVZ3 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc144bE9PVZ3 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc144bE9PVZ3 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc144bE9PVZ3 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc144bE9PVZ3 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc144bE9PVZ3 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc144bE9PVZ3 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc144bE9PVZ3 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc144bE9PVZ3 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc144bE9PVZ3 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc144bE9PVZ3 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc144bE9PVZ3 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc144bE9PVZ3 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc144bE9PVZ3 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc144bE9PVZ3 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc144bE9PVZ3 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc144bE9PVZ3 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc144bE9PVZ3 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc144bE9PVZ3 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc144bE9PVZ3 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc144bE9PVZ3 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc144bE9PVZ3 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc144bE9PVZ3 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc144bE9PVZ3 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc144bE9PVZ3 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc144bE9PVZ3 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc144bE9PVZ3 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc144bE9PVZ3 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc144bE9PVZ3 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc144bE9PVZ3 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc144bE9PVZ3 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc144bE9PVZ3 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc144bE9PVZ3 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc144bE9PVZ3 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc144bE9PVZ3 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc144bE9PVZ3 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc144bE9PVZ3 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc144bE9PVZ3 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc144bE9PVZ3 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc144bE9PVZ3 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc144bE9PVZ3 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc144bE9PVZ3 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc144bE9PVZ3 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc144bE9PVZ3 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc144bE9PVZ3 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc144bE9PVZ3 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc144bE9PVZ3 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc144bE9PVZ3 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc144bE9PVZ3 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc144bE9PVZ3 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms