Protein–RNA interactions for Protein: E9PVB5

Ttc17, Tetratricopeptide repeat protein 17, mousemouse

Predictions only

Length 1,198 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc17E9PVB5 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Ttc17E9PVB5 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ttc17E9PVB5 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ttc17E9PVB5 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ttc17E9PVB5 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ttc17E9PVB5 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ttc17E9PVB5 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ttc17E9PVB5 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ttc17E9PVB5 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ttc17E9PVB5 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ttc17E9PVB5 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ttc17E9PVB5 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ttc17E9PVB5 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ttc17E9PVB5 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Ttc17E9PVB5 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ttc17E9PVB5 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ttc17E9PVB5 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ttc17E9PVB5 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ttc17E9PVB5 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ttc17E9PVB5 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ttc17E9PVB5 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Ttc17E9PVB5 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ttc17E9PVB5 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ttc17E9PVB5 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ttc17E9PVB5 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ttc17E9PVB5 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ttc17E9PVB5 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Ttc17E9PVB5 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Ttc17E9PVB5 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ttc17E9PVB5 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ttc17E9PVB5 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ttc17E9PVB5 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ttc17E9PVB5 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Ttc17E9PVB5 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Ttc17E9PVB5 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ttc17E9PVB5 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ttc17E9PVB5 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ttc17E9PVB5 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Ttc17E9PVB5 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ttc17E9PVB5 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ttc17E9PVB5 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ttc17E9PVB5 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ttc17E9PVB5 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ttc17E9PVB5 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ttc17E9PVB5 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Ttc17E9PVB5 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ttc17E9PVB5 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ttc17E9PVB5 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ttc17E9PVB5 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ttc17E9PVB5 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ttc17E9PVB5 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ttc17E9PVB5 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ttc17E9PVB5 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ttc17E9PVB5 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Ttc17E9PVB5 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Ttc17E9PVB5 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ttc17E9PVB5 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ttc17E9PVB5 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ttc17E9PVB5 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ttc17E9PVB5 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ttc17E9PVB5 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ttc17E9PVB5 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ttc17E9PVB5 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ttc17E9PVB5 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.7 ms